從塔臺的談話來看，廣東、廣州、廣州民航多位領導齊聚塔臺指揮。他的命令是“禁止起飛”。幾乎與此同時，壹架來自成都的西南航空公司波音707降落在白雲機場。所有乘客下飛機後，機組人員迅速離開——不是因為知道劫機的消息，而是為了盡快趕到機場附近的菜市場。當時只有壹名船員留在船艙裏收拾東西。[3]
此時，滯留在停機坪上的飛機從南到北已經滿員。被劫持的飛機仍在機場盤旋，大量乘客滯留在候機室。機場的消防車停在跑道的北端。很快，壹群武警戰士跑進了機場。[3]
與此同時，波音757 2812機長曾壹直在監聽塔臺與被劫持飛機的對話。本來機艙的每個位置都應該有乘務員值班，但是因為情況緊急，機上所有的機組人員都聚集在駕駛艙內收聽。這個無意識的舉動讓他們僥幸逃脫。機艙裏的乘客就沒那麽幸運了。[3]
被劫持的飛機只有壹名飛行員操作，受到歹徒的嚴重威脅和幹擾。飛行員提出燃油不夠，要求在香港機場加油，然後把歹徒送到臺灣省。民航區域管制處同意飛機在香港加油，並聯系香港空管部門。但歹徒拒絕在香港機場降落，並威脅如果在香港降落就炸掉飛機。駕駛員在燃油不足的情況下，於9: 04緊急降落在廣州白雲機場。當飛機著陸後滑出時，歹徒對飛行員進行了暴力襲擊，導致飛機失控並偏離跑道...地面上的人看到，被劫持的飛機由北向南飛入機場，從下降到降落，壹切似乎都很正常。然而，當B737飛機沿跑道滑行約300米時，機頭突然偏離，轉向右前方，然後穿過草坪，壹路沖向航站樓。飛機接連通過跑道和停機坪之間的五條連接道路後，繼續加速，機身下的煙越來越大。在沖向最南端停機坪時，B737首先撞上了壹輛動車。這輛車停在剛從成都飛來的B707旁邊，正在為它提供動力。壹撞上，動車立馬調頭。這時，人們驚訝地看到，B737飛機正在被拉起，想要飛起來。但在升空過程中，撞到了B707的前部，B707的整個機頭都被切掉了。然後，飛機繼續向前飛，然後撞到了曾經是機長的B757的翼根。只聽“砰”的壹聲，B757冒出壹團火焰，從機翼上裂成兩截。然後，壹朵蘑菇雲升上了天空。壹次次闖禍的B737，在空中翻滾，落到地上，立刻散架。整個撞機過程不到壹分鐘。[3]
B737撞上B757後已經開始斷裂，可以看到有人從裂縫中掉下來。跑道北端的消防車立即趕來迅速滅火。煙霧散去後，我看到B757的機艙門已經打開，乘客正在滑下滑梯。“B737的速度太快了，幾秒鐘就撞上了波音707，然後它就向我們撲來了。”作為失事B757-2812的機長，曾表示當時沒有辦法處理。“只聽見‘砰’的壹聲，機艙裏突然濃煙滾滾，什麽都看不清。”曾立即切斷所有電源，命令機組人員打開艙門，準備滑梯讓乘客先逃生。直到機艙內無人應答，我才離開飛機。曾吳縣證實，他是最後壹個離開飛機的人。下飛機後，渾身是血的曾被地面的急救人員迅速送往醫院。經過檢查，他安然無恙。其他幾名機組人員因為當時在駕駛艙聽塔臺和被劫持飛機的對話，所以順利逃生。