長期以來，如果可能的話，上圖已經盡力保護古籍了。特別是1996新館的落成，大大改善了古籍收藏的條件。比如善本壹直恒溫恒濕保存，後來為了收藏國家壹級文物做了楠木盒子珍藏。1996在上海市委市政府的支持下，成立了搶救歷史文獻工作小組，如上圖，開始搶救整理多年來積累的大量未編輯文獻。這是上圖歷年來開展的最大規模的古籍整理保護工作。持續了近十年至今未停，成效顯著。比如，將建設總面積800平方米的家譜、碑刻專門圖書館；修復大量破損的家譜和部分碑刻；編纂出版了《上海圖書館藏書家譜概要》，反映藏書65438+1，000余種，65438+100多萬冊；初步摸清了館藏碑文的家世背景，其數據庫也正在制作中。這不僅有效地保護了塵封數十年的大量歷史文獻，而且使其可供讀者利用，取得了良好的社會效益。
但由於歷史原因，上圖中仍有約50萬部古籍和2萬多處碑刻，大量蟲蛀破損的古籍需要精心修復。受限於目前的人力物力，古籍整理保護仍將是壹場持久戰。
1990-1993年完成市文化局科研項目“古籍自動超高頻殺蟲劑”的研發，1993年獲文化部科技進步二等獎。
1994-1997年完成科研項目“館藏圖書資料用擬除蟲菊酯防蛀方法研究”，獲文化部科技進步三等獎1997。