這個故事在中國和日本家喻戶曉。至今仍有日本人聲稱自己是徐福率領的三千少男少女的後代。雖然這個美麗的傳說還有待進壹步證實，但隨著考古和人類研究的進步，日本人的祖先從何而來的問題越來越清晰。據日本《產經新聞》報道，現代日本人基本分為兩種，即“彌生型”和“繩文人型”(彌生和繩文人都是日本人對日本原始人的稱呼)。彌生人的特點是長而扁的臉，單眼皮，長眉毛，身材高挑。繩文人的特點是方臉或圓臉，棱角分明，雙眼皮，身材矮小，壹般是B型血。《產經新聞》稱，澤口靖子、斉藤由貴等日本著名演員具有文人特質，而巖下誌麻、鈴木民波則具有彌生的特質。
據壹些日本科學家分析，日本人的DNA 65%屬於彌生人，35%屬於繩文人。到目前為止，日本認為日本九州彌生遺址出土的人骨長臉高顴骨，是來自中國和朝鮮的外國彌生人。近日，中日兩國通過合作考古，對日本始祖彌生的起源有了新的發現。65438年至0996年，由中日考古學家組成的“中日江南人骨聯合調查隊”對江蘇省出土的60具人頭骨、大腿骨和牙齒進行了考古研究。在這些骨骼中，有28具屬於中國新石器時代，17具屬於春秋戰國時期，15具屬於漢前時期。通過從牙齒中提取DNA，與日本九州福岡縣和山口縣出土的古人骨進行比對。發現中國新石器時代的人類遺跡與古代日本完全不同。但春秋戰國及漢前時期的人骨與日本原始彌生人骨十分相似。江蘇徐州郊區“兩王城遺址”出土的人骨中的DNA與日本福岡縣出土的彌生骨中的DNA完全壹致。估計十幾代前是同壹個祖先。通過測量股骨，中國江南人的骨長與日本九州彌生人基本相同，鼻梁到門牙的距離也相同。這壹考古發現將為日本尋根尋祖提供新線索。在日本的外國彌生不僅有來自朝鮮和中國華北的，還有來自中國江南的，這可能是在日本的外國彌生之壹。對於中國江南人是如何來到日本的，日本專家說法不壹。壹種觀點認為是直接坐船去了日本。奈良縣考古研究所所長說，2500年前，是中國的春秋戰國時期，戰亂不斷。江南地區是中國最富裕的地方，當地人掌握了航海。為了逃避戰爭，江南人帶著稻種乘船逃到日本。因為有了稻種，就可以生產，可以生活。中國江南人的到來給日本帶來了水稻種植技術。他們到達日本後，選擇了九州北部，因為這壹帶的氣候與中國南方相似，適合種植水稻。另壹種觀點認為，江南人是通過朝鮮半島來到日本的。滋賀大學教授菅谷文認為，中國江南人從南方來到山東，跨過渤海灣到達朝鮮，再到日本。山口縣出土的人骨和山東省出土的人骨非常相似，就說明了這壹點。雖然日本學者對彌生人的起源爭論不休，但他們在壹點上是壹致的，那就是不否認古代日本的部分彌生人來自中國。