兩河流域的醫術在當時享有很高的聲譽，亞述和巴比倫的醫生經常外出會診。巴比倫醫生活躍在小亞細亞的赫梯帝國，在赫梯首都哈圖沙(今土耳其博阿茲卡萊，安卡拉以東150km)發現了壹批阿卡德醫學文獻，包括藥典、治療結膜炎、感冒發燒、自然分娩和陽痿的藥方。
在巴比倫後期，醫學使用魔法咒語來治療疾病。馬爾杜克是巴比倫的醫學之神。他擅長治療各種疾病，是魔術師之父。巴比倫陶片中有大量的咒語，這種治愈的方法和後期的非常相似，說明有些觀念是本能的，存在於潛意識的思想中，所以巫術幾個世紀以來都沒有改變。女神Aea是專門的醫學神，女神Ninghulsag在醫學神話中也很重要。還有八位神與她有關，每壹位神都能治病。尼努塔是很多醫神的頭，他的妻子叫加拉；另壹位醫神是尼那祖，他是醫生之王。他的兒子是紀寧世達，他們的象征是木棍和蛇。壹條名叫薩三的蛇被視為壹種象征，被視為醫神。
在醫療賬目中，各種發燒、中風、肺結核、瘟疫都有提及；精神疾病已被鑒定並認為是由創傷或魔鬼引起的；還有眼疾、耳疾、風濕、腫瘤、膿腫、心臟病、皮膚病以及各種性病。亞述人認為牙痛是由昆蟲侵蝕引起的，這和埃及人是壹樣的。黃色疾病被認為是由惡魔淺津引起的。"他可以讓他的身體變成黃色，讓他的舌頭變成黑色."浪費是由惡魔朝霞造成的。巴比倫的處方通常非常詳細。至今還保存著壹份用楔形文字寫在陶片上的醫學摘要，其格式分為三部分:第壹部分是病名，第二部分是藥名，第三部分是用法。所用藥物為各種植物的果實、葉、花、皮、根；橄欖、月桂、桃金娘、雞尾蘭、大蒜等。動物的各個部分和器官；還有明礬、銅、鐵等各種礦物質。此外還使用多種穢物，與其他古代民族相似。而是用汙穢趕走魔鬼，讓他離開病人的身體。制劑也有很多種，如丸劑、散劑、灌腸劑等。有各種各樣的工具將藥物註入陰道或直腸。
巴比倫的外科醫生很受重視，這可以從《漢謨拉比法典》的記載中看出。有些很有意義，比如明確認為醫生是壹個專門的職業，記錄有這個職業的人是怎麽做手術的。當時因為醫療水平低，外科手術不多。兩千多年前，剖腹產等復雜的外科手術就開始被記載在法律文書中，但手術只是在非常危急的情況下進行，很可能是患者家屬抱著“死馬當活馬醫”的心態，向醫生求饒。如果病人死了，醫生是逃不掉責任的。這些記載是最早規定醫生刑事責任和民事責任的文件，具有很大的史料價值:“醫生用手術刀施行大手術而使病人死亡，或用手術刀切開膿腫而毀壞眼睛的，以斷手之罪處罰”，“醫生治愈骨病或器官疾病的，收取五個銀幣；如果病人是雇傭的奴隸，他將得到三個銀幣，他的主人將支付兩個銀幣。”
可見古代蘇美爾醫生的社會地位並沒有今天西方發達國家高。古代文獻把他們和占蔔師、客棧老板、面包師放在同壹個層次，他們最多是社會的中產階級。但也有少數醫生，憑借高超的醫術，擠進宮廷，擔任宮廷醫生，從而獲得較高的社會地位。這些醫生專門為國王、王後和達官貴人服務。有時，他們被派往外國，招待外國元首，擴大他們作為和平使者的威望，鞏固盟國之間的友好關系。
亞述時期，宮廷醫師有專門的管理機構，負責人是國內最有威望的醫生，稱為Mashmatu或Ashibu。古波斯帝國時期，不僅有國內的醫生，也有國外的醫生。壹些著名的希臘醫生跟隨國王很長時間，他們非常了解波斯的情況，留下了許多珍貴的記錄。希臘醫生克斯特亞修斯曾經寫過壹部波斯史，其中的壹些章節至今仍然存在。薩珊帝國時期，由於拜占庭教會迫害異教徒，許多希臘名醫逃往伊朗。伊朗人在Gundy Shahpour為他們建立了世界上第壹所醫科大學。該校使用的教材被文藝復興時期意大利的醫學院廣泛使用。