X版本限制的寵物有:海星星、寶石海星、大甲、達魯比、赫盧加、德國牧羊犬、大狼犬、可可多拉、科爾多拉、博斯科爾多拉、打鬼、小妖精及其進化。
デッポア及其進化ブロスター(龍蝦)，妖精是神獸ゼルネネスス(即神x)。
Y版本限定的寵物有:大舌殼，鐵甲殼，赫拉克洛斯，尤奇拉，夏奇拉，班吉拉，雷洛壽，閃電獸，扒手貓，酷豹，放映員，妖精靈，及其進化。
另外，兆進化需要的兆石版本有限。X版僅限於:噴火龍石X，超夢石X，赫拉克洛斯石，班吉拉石，閃電獸石。版本Y:噴火龍石Y，超夢石Y，大甲石，Bosco哆啦a夢石，赫魯加石。
所以可以根據自己對壹些PM的喜好來選擇版本。另外，如果妳可以在線連接，如果妳的在線夥伴選擇了某個版本，那麽妳可以選擇另壹個版本，通過專屬寵物的交換來收集圖片。
(糾正樓上觀點，X神和Y神種族值相同，而且X神有專有強化術，土蔔，攻擊力更大，在實力上優於Y神。)