1，年代不同:永樂大典是明朝永樂年間。明史清朝順治二年(公元1645年)，建立明史館，編纂明史。
2.內容不同:《永樂大典》包括經、史、書、集，涉及天文地理、陰陽醫學、占蔔、藏傳佛教道教、戲劇、工藝、農學，涵蓋了中華民族幾千年的智力財富。《明史》以編纂得當、資料翔實、敘述有聲、文筆簡練而被史學界所稱道，是壹部高水平的史書。