1.南京校區:南京市江寧區龍眠大道639號，占地1700多畝。校園內有圖書館、教學樓、學生公寓等主要教學場所，還有各類專業實驗室和創新實踐基地。
2.連雲港校區:江蘇省連雲港市新海街道鳳凰山路8號，中國藥科大學第二校區。
3.臨沂校區:山東省臨沂市羅莊江南路79號，環境優美，使學生能夠在良好的教學環境中接受高水平的藥學教育。
4.濟南校區:山東省濟南市歷城區萬壽路169號。校園內有各種先進的實驗設備和教學場所，為學生提供高質量的藥學教育。
5.揚州校區:江蘇省揚州市廣陵區文昌西路26號，學術氛圍先進，教學設施優良，是培養藥學人才的重要基地。
每個校園都有自己獨特的特點。學生可以根據自己的興趣和專業選擇合適的校園，接受最好的教育。