指揮收復臺灣省行動的施瑯壹結束兩岸對峙，就立即上奏康熙，建議清朝效仿400年前元世祖的忽必烈兩次征討日本的軍事行動，鏟除明朝以來盤踞海外的倭寇隱患。
施瑯提出進攻日本，著實讓後人驚嘆。如果康熙批準實施，成功攻占了日本列島，那豈不是還有200多年後的甲午中日戰爭發生的那些事？
但當時清政府還面臨著諸多內憂外患，跨海遠征日本的作戰思路並沒有出現在此時滿清高層的首要考慮中。
康熙繼位初年，清軍剛剛從緬甸奪回南明李詠皇帝朱由朗，並在雲南處死，暫時結束了前明反清復辟的活動。但隨之而來的是，輔政大臣鰲拜驕橫自私；雲南、廣東、福建的三藩勢力挾洋自重，每年消耗清政府近壹半的軍餉和糧食；臺灣省鄭氏家族占據臺澎金廈，襲擾東南沿海；西北邊陲新崛起的準格爾汗國壹直在吞並磨溪、漠北等地的各蒙古部落，其壯大趨勢明顯。而且沙俄從西伯利亞入侵jaxa，在女真的家鄉修建城堡防禦設施，頻繁制造邊境摩擦。
此時，康熙雖已剿滅三藩，收復臺灣省，但西北準噶爾汗國和東北俄國仍有兩大隱患。尤其是準格爾汗王葛爾丹，更是有著幾百年前鐵木真的氣勢。如果清朝不采取果斷的軍事幹預，就很難保證不會重蹈成吉思汗蒙古鐵騎攻滅中原金朝的覆轍。
回過頭來看看滿清八旗最初的中堅力量——建州女真的崛起。如果不是豐臣秀吉在倭國關白野心勃勃的擴張，發動了兩次進攻朝鮮半島的大規模計劃，導致明朝遼東的軍事力量被牽制在外，努爾哈赤怎麽可能奇跡般的順利成長？如果康熙現在消耗國力，讓施瑯領兵進攻日本，豈不是讓葛爾丹成長為努爾哈赤？
強大的明軍還在陸地上和日軍拖了很久，更別說讓清軍穿過比臺灣省海峽寬得多的日本海去奪島了。基於清初的生產技術條件，後勤補給、信息通訊以及後續的海上軍費都是壹系列難以解決的問題。
元世祖忽必烈大規模征討倭國，兩次都以失敗告終，壹直被後人認為是浪費民財、動搖國本的輕率之舉。於是，當日本侵略者肆虐明朝東南沿海時，明太祖朱元璋並沒有壹怒之下做出攻打日本的決定，而是在對日外交和東南海防方面做出了相應的調整。對歷史有很深借鑒的康熙自然明白道理，不會輕舉妄動。
最後，我們來看清朝對俄國邊界問題的處理。清軍在與俄軍進行了壹段時間的軍事接觸後，很快坐到了談判桌前，解決了邊界劃界爭端。在隨後的《尼布楚條約》中，清朝割讓了外興安嶺以外的大片地區，清朝的版圖只包括黑龍江和烏蘇裏江流域以及庫頁島在內的部分地區。
從清朝對俄國的大租界可以看出，清政府顯然是以鞏固漢朝的中原和江南地區為重點的。外興安嶺曾經是野蠻女真的故鄉，但清政府還能對俄國讓步，更別說指望清政府的決策層對日本列島這個遠離大海、全國貧困的地方提起足夠的興趣了。
而且當時統治日本的江戶幕府政權，經歷了德川家康、德川秀吉、德川廣佳連續三代的閉關鎖國政策的嚴格執行，日本侵略者騷擾清朝沿海的問題幾乎絕跡。清朝與江戶幕府的外交關系趨於正常化，施瑯所謂的對日作戰、消滅日寇的理由很難打動康熙。