整套書分為經、史、書、集四個部分，共44類。還包括《論語》、《大學》、《孟子》、《中庸》、《周易》、《周立》、《禮記》、《詩經》、《孝經》、《尚書》、《春秋》、《史記》、《爾雅註疏》、《說文解字》。
《四庫全書》編纂
清乾隆三十八年(1773)，朝廷設立“四庫全書館”負責編纂《四庫全書》，由乾隆六子顏勇任館長，任命長公主余敏忠為社長，大學士、六部尚書、侍郎為副社長，並召著名學者紀昀為主編，開始編纂這部卷帙浩繁的書。陸、孫士毅、戴震、周永年、邵等學者也參加了編纂。有3600多位學者、學者參與編纂並正式上市，有3800位文案。
《四庫全書》收錄了當時全國各地收集的流通書籍、清代朝廷收藏的書籍和《永樂大典》編纂的善本。據統計，僅藏書數量就達13501。經過篩選，這些書是按照“書目書”和“書目”收集的，其中“書目書”並不記載整本書，只是摘錄部分內容，而“書目書”是經過整理、校勘、考證後，以特定的格式復制保存，復制後還要與原文反復校勘。最後是3461本書。
為了美觀和易於識別，《四庫全書》采用分色裝飾，經線為綠色，歷史為紅色，分系為白色(或淺藍色)，收藏為灰黑色。四種顏色的確定取決於四個季節:春、夏、秋、冬。因為《四庫全書》的目錄是全書的大綱，所以采用了代表中央的黃色。
乾隆四十九年(1784)，四套書陸續完成，全書七冊，分別存放在北京故宮的文遠閣、京郊圓明園的文遠閣、奉天宮(今沈陽)的文水閣和承德避暑山莊的金文閣，合稱“故宮四院”(或“北四閣”)。文宗閣建於鎮江金山寺，文慧閣建於揚州大觀堂，溫嵐閣建於杭州西湖宮鼓山聖音寺，即“江浙三閣”(或“南三閣”)，各有壹份。壹份副本保存在史靜皇家藝術學院。其中文遠館完成最早，校勘更精，字體更工整。
乾隆五十二年(1787)，乾隆皇帝發現部分書籍在《四庫全書》中有謗文，於是下令對《四庫全書》進行重新檢查，最終刪除了11冊史書異同記錄。不過，這11本書雖然從《四庫全書》中刪除了，但仍然存在於宮中，並未被銷毀。這11本書有9本至今還在流通。
嘉慶八年(1803)，紀昀主持了《四庫全書》官書最後壹部分的補充工作，進壹步完善。
刪改古籍
清廷在編纂《四庫全書》時，為了維護自己的統治，用所謂的冒犯性文字，查禁了大量明清古籍。見四庫禁書。以及大量篡改古籍，如嶽飛名句《滿江紅》“餓了吃豬肉，笑了渴了喝匈奴血”。“葫蘆”和“匈奴”在清朝是禁忌，於是四庫的圖書管理員把它改成了“饑食、食肉、談笑”。張孝祥的名篇《六國之歌，望長懷斷臂》中描寫孔子故裏被晉人占領，“在陸地上唱歌也是有貓膩的”。其中“腥味”為禁忌，改為“亦枯”等。
《斯Ku全書》的命運
《四庫全書》成書二百年來，中國歷經動蕩，《四庫全書》也歷經滄桑，許多手稿毀於戰火。其中國源館於1860年被英法聯軍攻占，圓明園焚毀時被焚毀，而文宗和文慧館在太平天國運動中被毀。杭州文瀾閣圖書館大樓在太平軍第二次攻占杭州時1861倒塌，《四庫全書》散落民間。經過圖書館藏書家丁兄弟的清理、整理和補充，原書的四分之壹被搶救出來，於1881再次存放在修復後的文瀾閣。民國時期溫嵐館再次大規模修繕，目前大部分內容已修復。所以《四庫全書》現今僅存四冊，其中文遠館原藏於北京故宮，後經滬寧轉運至臺灣省，現藏於臺北故宮博物院(也是保存較為完好的壹部)。文歲閣在1922年差點賣給日本人，後從沈陽故宮轉移到蘭州，保存在甘肅省圖書館。金文館現在保存在中國國家圖書館，而不完整的溫嵐館保存在浙江省圖書館。
1966 10為了保護《四庫全書》的安全，在中央有關部門的協調下，遼寧省秘密將《文歲閣四庫全書》運至蘭州，藏於深山之中。目前遼寧有關人士為了“書亭合壹”，要求歸還。甘肅也建了圖書館加強保護。溫穗閣《四庫全書》的最終歸屬還不確定。
民國初期，商務印書館影印了第壹批《四庫全書》善本。臺灣省商務印書館影印出版了葛的《四庫全書》。上海古籍出版社把它縮小了。從65438到0999，上海人民出版社和香港中文大學分別出版了葛《四庫全書》的電子版。