永嘉之末，被石勒所圍。然而，石勒蘇益格-荷爾斯泰因壹直對2000石的官員懷恨在心。聽說鄧佑在營中，急忙召見，準備殺鄧佑。鄧佑到了營門，門童是鄧佑在郎時的老部下。認識鄧友，鄧友向他要筆和紙作為告別詞。門衛拿著鄧佑的辭呈去了後羿樂。太都很誠懇，很和氣，呈上了鄧佑的演講稿。樂很看重他的話，沒有殺他。樂長史張斌，曾與尤廉同居，非常重視鄧佑的名聲和操守，所以在樂面前說鄧佑的好話。樂招鄧佑為幕僚，與他相談甚歡，很喜歡他，被任命參軍，供給他車馬。樂每次出行都帶著鄧佑在營地裏。禁止夜間生火，違者必死。鄧佑與胡人鄰車，胡人夜間起火，毀車。官員質疑時，胡人誣陷鄧佑。鄧佑覺得沒辦法跟他們吵，就回答說是因為他嫂子用溫酒點著了。樂赦免了他。事後胡人很感動，就克制自己，去見樂解釋鄧佑，於是偷偷給了鄧佑壹匹馬和驢。許多胡人尊敬他而不嘆息。石勒蘇益格渡泗水時，鄧佑破車而逃，背上妻兒。他們又遇到賊，帶著他們的牛馬，不得不徒步，背著他的兒子和他哥哥的兒子隋。他覺得自己救不了兩個孩子，就對妻子說:“弟弟死得早，就這壹個兒子。蒼天不能死，只好棄我兒子而去。如果我有幸活下來，將來應該會有孩子。”妻子哭著答應了，於是放棄了孩子。他兒子早上拋棄了，晚上會追上來。第二天，鄧佑把兒子綁在樹上，走了。
到達新鄭後，他時刻投奔李。三年後，我打算離開，但李壹刻不同意。荀集團任命他為陳郡、汝南知府，漢武帝又招他為左丞、資政、長水校尉，但他沒有上任。後來他偷偷溜走，投靠了許昌的荀集團。李壹瞬間恨透了他。過了很久才把家人還給鄧佑。鄧佑壹直和刁協、周鄂關系很好，所以去了江東。元帝指定鄧佑為太子的私生子。當時吳郡缺太守，很多人想做。元帝把這個位置讓給了鄧佑。鄧佑提著米去上任，不領俸祿，只喝五水。當時郡縣大饑，鄧佑表明了朝廷的救濟，但沒有得到答復，於是私開倉庫放糧。臺裏派了壹個常侍給桓伊和於飛，安慰饑民，了解鄧佑政治的好壞，於是有人彈劾鄧佑私自分糧。不久，法院原諒了他。鄧佑在中興時期是個不錯的太守，因為他的刑政清明，民心所向。病後離崗。縣裏發了幾百萬，鄧友身無分文就走了。幾千人守著鄧佑的船，鄧佑就停下來，晚上走了。吳國的人稱贊他說:“這就像打五面鼓，雞在天上叫。鄧侯不能留，謝玲不能推。”民眾要求臺灣留在鄧友壹年，沒有得到答復。拜為仆。壹年後，他被調到吏部。菜吃壞衣服，節儉扶貧。人性謙虛，喜歡和人交朋友，客人平等，還挺會拍馬屁，很有實力。
永昌年間，改周鄂為護軍將軍。泰寧二年，王敦造反，密謀起兵，於是提拔鄧佑為會稽太守。當初，王敦伐京師後，內外兵馬數量每月向敦報壹次。鄧佑在家已經離開了政府，不再懂得保護軍隊。有人惡意誣陷鄧佑，說鄧佑把兵馬數目告訴了王敦。明帝聽說後不相信，於是成了鄧友太的常侍。當時，明帝去了南郊，鄧佑因病不能陪同。明帝去問鄧佑的病情，鄧佑請了病假以顯示他的力量。且說鄧佑不能往城外，只得在路旁拜謝，赦之。鄧佑無論是升是降都不會開心。過了很久，他被提升為尚書右侍郎。仙和元年，賜光祿大夫，金質綬帶，殿中少年。
鄧友拋棄兒子後，妻子不再懷孕。過河後，他娶了壹個妾，這個妾很喜歡他。他問自己家在哪裏，說北方人倉惶逃走了，壹問父母名字，才知道是鄧佑的外甥女。鄧佑壹直很賢惠。他聽後非常懊悔，於是不再納妾，死而無子。當時人們覺得他很義氣，哀嘆他，對他說:“不知天理，使鄧波之道無子。”他的學生為他哀悼了三年。