到目前為止，全世界已經發現了21個水晶頭骨，其中最著名的是考古學家弗雷德裏克·艾伯特·米切爾-赫奇斯擁有的末日頭骨，也被考古學家稱為米歇爾-哈吉斯水晶頭骨。
瑪雅文化的壹個重要部分是對頭骨的崇拜。頭骨是瑪雅神廟中祈禱占蔔的重要工具。阿茲特克祭司會用包括石頭和骨頭在內的各種材料將其磨成頭骨的形狀，用於祭祀。
而壹個著名的瑪雅傳說，意味著古瑪雅人留下了13個水晶頭骨。當這13個頭骨湊在壹起，就能說話，預見人類的未來。這13顆頭骨的排列是根據12顆行星的排列位置，最大的壹顆在中間。整個結構被稱為“奧西利亞康維亞方舟”。