《藝苑》中記載，桓玄出生時，室內光線充足，壹個擅長占蔔的人說:此子壹生奇妙，觀天人相宜。並取名為申申寶。桓溫嫌他的名字有三個字，就把神二字減去，稱之為靈寶。
歷史學家周壹良認為，桓玄的“有道”、“靈寶”等名字是桓信仰道教的象征。
桓玄壹怒之下，殺了那只鵝，和他的堂兄弟壹起打那只鵝，可是桓玄體內的鵝總是不如他的堂兄弟強壯，所以他很生氣。所以壹天晚上，我去鵝圈殺了我堂兄弟的鵝。天亮後，家屬們驚恐萬狀，以為發生了什麽怪事，向桓沖報告。桓沖知道是桓玄做的。壹問，果然發生了。
地面擡不動桓玄稱帝後的皇宮，他坐在床上。突然，床破了，大家看到這個都面無人色。尹忠文受寵若驚，說，陛下，您的神聖意義深遠，地球無法承受。這讓桓玄非常高興。
桓玄擅長寫文章，從他的事跡就可以看出來。王恭死後，桓玄去江陵南塔說，我現在要為王小波做祭文。念叨了半天，開始寫，很快就寫完了。
桓玄滅了尹仲堪和楊_，荊州刺史府、江州刺史府、後將軍府、七州總督府、南郡府都來道賀，五版簡牘壹起入。桓玄看了版次，都是好看的，合乎邏輯的，並沒有混用。
桓玄喜歡裝飾和書畫。擊敗司馬原憲後，桓玄遷都固鎮，城內府衙、建築、假山水池金碧輝煌。此外，他曾用獨木舟搬運齊新書網的繪畫、服飾和玩物，因此有人訓誡他。桓玄居然說這些東西要帶在身邊，還說當時戰事激烈，如果有問題可以趕緊離開。大家聽後都嘲笑他。
桓玄喜歡收藏書畫，特別珍惜。每當有客人來訪，他就給他們看他收藏的書畫。有些客人在吃了桓玄主持的冷食器皿後，沒有洗手就碰了這些書畫，以至於書畫沾上了油汁。桓玄很不高興，所以從來不為來訪者設置任何冷檔。後人用桓玄冷油的典故來指代書畫鑒賞。
桓玄因劉裕討伐而西行至江陵時，在路上做了壹個筆記，內容全是他反抗劉裕叛軍的事。他聲稱自己指揮軍隊，這是壹個明確的計劃，他被打敗只是因為將軍們違反了他的節日，這是壹個戰爭罪。因為桓玄專心寫巨著，沒有閑功夫和群臣商量對策。寫完後，桓玄宣布居朱遠方。
桓玄崇敬其父桓溫，所以在他篡位稱帝後，拜桓溫為宣武皇帝。祠堂只拜他，不拜他祖父桓伊以上。
所以，當桓玄遭到劉裕叛軍的攻擊時，曹靖說這讓進士神飄流，又說他不像祖父那樣恭敬，觸怒了神靈，這讓桓玄非常害怕，心生怨恨。
歷史學家田雨晴認為，桓玄的祖先很可能是三國時被司馬懿殺死的桓範。他的後代桓愷、桓浩，漏網之魚，直到風頭過後，才入晉為官。桓玄取代金之後，他們不願意透露桓家史的真實故事，諱莫如深，所以不尊重祖先。
據說元興年間衡陽有壹只母雞變成了公雞，但八十天後雞冠萎縮了。後來桓玄建立楚國，衡陽郡在十郡之內，從桓玄即位到建康大敗，大約八十天。當時也有童謠:長幹巷，長幹巷，今年殺郎軍，後年斬首朱環。丈夫是司馬，元興元年被殺，元興三年因桓玄戰敗而被殺。