壹、孔子與六經的關系。認為六經是周代幾部不相幹的書。它們既不是中國古典經典學者所說的“六經是周樹的舊經”，也不是中國現代經典學者所說的“六經是孔子的作品”。孔子沒有刪改或產生六經，它們的結合是在戰國末期(見古史第壹書)。
第二，關於古今文學。在《古史辨》中，錢、錢穆、、王等人的論文相繼發表，並就此展開了熱烈的討論。其中最重要的是錢對經典、現代和古代文學問題的重新探討。(參見《古代史辨析》第五冊)
第三，專業經典研究:
在《周易》中，顧頡剛的《論〈易經〉與〈象傳〉的比較研究》壹書、李的《易註辭》及《周易考辨》、於的《易卦》、《易辭》的時間及作者、榮昭祖的《蔔筮源流》等都是頗有影響的著作。在《尚書》方面，本文對《金文尚書》中的堯典、龔宇、盤庚、金藤等的時間和真偽進行了探討。
《詩經》方面，《古史研究》第三卷集中討論了《詩經》和《毛詩序》的問題，發表了胡適、錢、顧頡剛、劉大白、鄭振鐸、周作人、俞平伯、朱自清、、魏等學者的文章，各抒己見。主旨是否定《詩經》這種所謂聖人的“遺風”，認為它只是壹首民歌；他還否認孔子刪詩，認為詩與孔子無關。在《春秋》中，重點論述了《春秋》的性質、孔子與《春秋》的關系以及對《左傳》的考證。
其他方面，有關於古文《孝經》的真偽、分歧、作者的討論；《論語》考證；有關於《大學》和《中庸》時代的討論，等等。
古代懷疑論學派對於打破長期以來“唯信古”的傳統觀念，將經典作為現實科學研究的歷史文獻，起到了積極的作用。古代懷疑論學派的許多研究成果至今仍是研究中國古代史和儒家經典的寶貴學術文獻。當然，不可否認的是，在古代學派的研究中，存在著壹些武斷和片面的東西。