35歲時，漢武帝派他到雲南、四川、貴州等地。父親司馬談死後，司馬遷繼位做官。
公元前104年(太初元年)，開始編纂史籍。公元前99年(天漢二年)，李陵攻打匈奴，戰敗投降，漢武帝大怒。司馬遷袒護李陵，觸怒漢武帝。他被逮捕並被判處死刑。
為了完成父親的遺願，完成史記並留給後人，忍辱負重地忍受“腐敗(割掉鼻子或生殖器官的酷刑)”。
公元前96年(太史元年)，被赦免出獄，下了書面命令，掌握了皇帝的機密文件。於是他發奮著書，致力於寫史記。55歲左右，他終於完成了整本書的寫作和修改。
擴展數據:
在漢代的占星家中，應該首先提出的是司馬遷。大家都知道司馬遷是偉大的歷史學家，卻不知道他也是天文星象專家。
其實，只要妳仔細讀壹讀他在《史記》中的官書，就能明白，稱他為天文星象專家絕非虛名。像司馬遷這樣博大精深的文學大師，絕不會劃定自己的範圍，限定自己的知識體系和探索領域。
古代歷史學家本來就把星歷表作為自己的職責之壹，所以精通占星術也就不足為奇了。司馬遷沒有用星占學來衡量具體的人事變動，而是總結歷史規律，這不能說是他對銀河學的創造性應用。
參考資料:
百度百科-司馬遷