第65438集+0
天還沒亮，六歲的葉璇已經在冰天雪地裏，趕到蒙古博物館學習，但還是遲到了半個小時。太傅魏鞭打正在讀書的的兒子。順治皇帝下令所有王公都要審判朝廷，並根據朝廷的情況對師徒進行獎懲。這步棋其實是選擇順治有意成佛的兒子，請和尚法師興森幫忙。
第二集
皇宮裏的太監要活埋蘇馬拉姑媽。幸好太後小莊趕到，攔住了她，讓蘇馬拉大嬸離開了皇宮。順治被湖北貴妃和葉璇的病情所困，對佛的心越來越重，大臣極為焦慮。順治在杭森的建議下，為禦女鄂舉行了佛事道場，佛音滿庭。四方爭相打高，大臣們無奈之下闖入道場，企圖勸退車夫。
第三集
順治終於為索尼打開了大門，並表示將在日出前決定自己的目的地。大臣們於是告訴了孝莊太後。孝莊皇後命索尼去找行癡包打聽毓麟秀，請他給行癡治病，並為朝廷做了安排。
第四集
玉林李秀責怪興森，說勸皇帝出家壹定會引起朝廷生氣，傷害佛教，但他據理力爭，始終不改初衷。順治對禪宗葉璇感興趣，問葉璇是否敢當皇帝。葉璇態度堅決。
第五集
魏程默主持了康熙的即位儀式。而等權臣卻以魏是漢人為由，提議由的養子滿人吳執掌朝政。為了穩定政局，孝莊皇太後不得不妥協，改由吳主持皇位，並封、索尼、秦碧龍、蘇克薩哈為侯爵主持朝政。
第六集
鰲拜得寸進尺，向孝莊皇太後提議更換科舉老師，說魏控告他，圈地是誣陷。孝莊皇太後為了大局，批準了的請求，同意了提出的欽差大臣人選，但同時提出魏為外省巡撫。
第七集
康熙問季氏是怎麽學的，季氏說自己只是個秀才，希望兩年內達到秀才的水平。康熙決定匿名參加科舉考試，於是努力學習。考童吳慈佑在酒店門口餓死，被明珠救下。
第八集
科舉考試當天，吳慈佑先交了自己的試卷《論圈地與混沌》，康熙也在另壹個房間匿名參加考試。入土釋榜後，康熙榜上無名，極度抑郁。蘇克薩哈來報，請康熙為前三進士。康熙發現自己的化名是高中前三的卷子，羞愧的辭去了禦用老師。
第九集
另壹方面，鰲拜威脅，康熙無力控制局面，只好逮捕蘇克薩哈。孝莊皇太後回京後，嚴厲斥責康熙。、高、龍和班布爾見了孝莊皇太後，假裝自責。
第10集
另壹方面，索尼主張康熙領導國家，鰲拜反對但不敢妄自菲薄。康熙故意三言兩語，最後在眾臣的支持下，開始親自治理國家。當好時回到索福，索尼警告她的孫女要小心。
第65438集+01
六個人進行了手寫投票。除了寫“尹”外，其他五個人都寫“費”，而決定費俊..康熙又去找吳慈佑讀書，蘇馬拉大媽越來越喜歡吳慈佑，給他縫了壹雙新鞋。
第12集
鰲拜的密探報告說，康熙與吳慈佑來往頻繁。班布爾在吳慈佑中提出要殺康熙，然後歸罪於吳慈佑。這時，康熙來了，鰲拜假裝生病。
第13集
在關鍵時刻，吳六壹帶著他的軍隊趕到了，與班布爾展開了戰鬥。康熙思慮再三，才走出大殿，上朝。康熙下令皇帝審判鰲拜的案件，並讓魏東亭身邊的臥底出現，稱贊魏東亭是壹個忠臣。
第14集
馬謖·拉古終於開門後，她剪了很多頭發。孝莊皇太後無奈，決定新建壹個尼姑供她永久居住，帶著頭發去修行。朝政之上，康熙讓朱國治奏彈劾吳三桂，群臣沈默謹慎；後來他讓吳三桂演彈劾朱國治，誣陷朱國治挾洋自重，割據政權。
第15集
康熙來到獄中，想殺朱國之，但他說殺他不是因為誣陷吳三桂，而是為了國家爭取兩年的穩定。後來，他將被證明是正確的，他的後代將被密封。朱國治慷慨赴死，康熙卻下令釋放枷，說殺忠臣本身不是昏君，並命朱國治為雲南巡撫，以牽制和監視吳三桂。
第16集
在三藩討論撤藩的時候，假扮朱三太子的楊其龍登門鼓動“反清復明”，被吳三桂拿下，後又被吳三桂有意釋放，以利用楊其龍對付朝廷。黃靖向楊其龍通風報信，說康熙要出京。吳三桂給朝廷寫了辭呈，背後卻是在軍事上的大動作。
第17集
康熙將錯就錯，讓魏東亭核實情況，把周雲龍處死，然後給他節哀。王見了康熙，康熙以禮迎之，封他為峽將軍領兵。他兒子留在北京陪他。
第18集
吳對吳三桂的修改表明康熙已經決定退出三藩，但內部仍有分歧。新任雲南巡撫朱國治拜見吳三桂，宣讀了康熙同意吳三桂辭職的聖旨。吳三桂表面上表達了聖旨，將拒絕退出諸侯的部下斬首，並向朱國之家送禮。
第19集
朱國治向吳三桂傳達朝廷同意收回所用錢糧數量，吳三桂交出平璽，稱收回日期履行完畢。吳三桂寫信給吳熊英，告訴他離開北京，回到雲南。吳決定暫時不離京，以便麻痹康熙，面見，並捐款支持起義。
第20集
康熙懷疑宮中有楊其龍的亂臥底，就故意鞭打太監的小拇指，讓他混入亂臥底中。吳三桂勢力瞄準朱國治，封鎖關隘，準備起義。朱國治讓欽差去北京向康熙報告吳三桂起兵的情況，但他拒絕逃離雲南。
第265438集+0
魏東亭趕到沈睡的月亮樓，紫雲已經死在康熙的懷裏。小俄國人報告說吳三桂造反了，但康熙不相信，讓他拿著信物告訴楊其龍，康熙被毒死了。
第22集
小俄國人越獄了。孝莊皇太後嚴詞責備康熙，要他振作起來。楊其龍亂黨闖入宮中，宮中太監造反，與朝廷士兵激戰，威脅到康熙和孝莊皇太後的安全。
第23集
周培公和圖海中尉率領軍隊勢如破竹，很快就摧毀了察哈爾國王的叛軍。解除朝廷危機後，出兵西南，逼退吳三桂叛軍。
第24集
康熙接到福建軍事危機的報告，非常擔心。康熙遇到了奄奄壹息的周培公。康熙坦誠地告訴了周培公自己被貶盛京的原因，並說此行的目的之壹是安撫蒙古各族首領，同時想重用周培公攻臺省。
第25集
康熙為了打擊姚啟勝的傲氣，把他扔進了監獄，把他的大哥尹子送去福建當副將。姚企生在獄中，康熙不許任何人和他說話，姚企生憋得要命。
第26集
康熙叫姚啟聲坐在他的車裏。姚啟勝嗜書如命，於是偷了康熙的壹本書，經常讀。康熙斥責姚啟聲狂妄自大，蔑視滿人，並表示願意與他探討漢文化。姚啟勝自責，說康熙是聖人，學問堪比大宗師。當康熙回到北京，把這本書送給姚啟勝時，姚啟勝深受感動。
第27集
小莊希望滿漢通婚，讓哥哥和格格與漢族通婚，化敵為友。康熙誤舉了惠妃的牌子，發現後換了榮飛的地方。慧妃滿腹不快，責怪太監李德全，無奈只好半途而廢。
第28集
康熙接到鄭經要求談判的信，命明珠去臺灣談判，並定下三個原則:剃發、聽話、落地。從姻親背景和軍史來看，福建巡撫姚啟勝的妹夫是潘虎措、黃希瑜，曾任清東閣大學士(總理)軍部；掌管兵部的內閣大臣潘虎錯黃汐源的妹夫是福建水師提督施瑯。
第29集
施瑯進京拜見康熙，康熙封他為大將軍提督。施瑯主動提出不與姚啟勝來往，康熙賞賜他壹份密折。寶日龍梅來到首都，直奔皇宮。尹子大怒，打了前來追捕寶日龍梅的格丹官兵。
第30集
為了節省開支，榮飛建議後宮勤儉節約，請惠妃負責此事，康熙允準。在掌管兵部的盤閣大學士(宰相)的支持下，施瑯的真知灼見感動了康熙和朝中大臣，姚啟勝在眾將士面前樹立了施瑯的威信。
第365438集+0
康熙說，他不想讓寶日龍梅和他在壹起，因為他不想為任何人所用，但他會消滅格丹，恩施寶日龍梅和蘇馬拉在壹起。尹感到極度的沮喪。蘭吉爾派李光地到福建上任，又見到了葛爾丹。
第32集
洞庭水師全軍覆沒，施瑯卻凱旋而歸。康熙下令索圖圖回京。姚啟勝打了壹個點球，康熙允許他回家省心。姚啟勝離職前給康熙打了九折，說攻臺前曾給康熙三次急訪，康熙都沒有接待。他大怒，下令徹查，兵部辦案官員背黑鍋，在幕後保護主子。
第33集
珍珠與鄭經使者馮希凡討價還價，初步達成求愛條件。但最後馮希凡提出鄭靜要三年後才能登陸，他得寸進尺，於是康熙決定和鄭靜開戰。姚啟勝重新啟用。
第34集
蘭向孝莊太後哭訴，孝莊講了自己的經歷，說女人要為大清國做出犧牲。蘭·麒兒說她父親將來壹定會毀掉格丹。她應該如何對待？
第35集
康熙巡視南京，途中接到福建的報告，要求進攻臺灣推遲壹天，康熙下令臺灣必須按原定日期關閉。姚啟勝說，這是康熙為重陽節在明陵宣布的綱領，以此撫慰大明遺民的心。
第36集
葛荔親自領兵到棲霞寺找銀子，也找到了三門大炮。魏東亭說棲霞寺的銀子也要上繳，但楊其龍逃脫了。康熙懲罰了魏東亭的失職，給了他兩條出路。魏東亭選擇去太棚做知縣。
第37集
索托圖在家裏暴露了蔡主任的臥底身份，蔡主任自殺了。在官員的任命上，明珠也給李光地施加了壓力。李光地拜訪馬謖拉古，傾吐了自己的心事，說自己想做壹個有學問的學者，卻陷入了官場，被夾在夾縫中，並把自己的老師吳次友叫來，激起了馬謖拉古的無限感慨。
第38集
葛爾丹燒了康熙的聖旨和禮物。康熙親自率軍攻克，寶日龍梅也想參戰。康熙制止了這件事，並命令寶日龍梅不得離開首都。
第39集
葛爾丹兵分兩路逼近康熙大營。康熙自覺可能回不了京城，留下遺詔，想立尹接任。明珠極力勸阻，說殷在北京造謠，急於登基。康熙急了，病情更重了。
第四十集
尹在康熙面前聲稱，她是在壹次激烈的渡河戰鬥後被洪水沖走的。康熙說這次親征對葛爾丹來說是壹個很大的挫折，以後還是想用親征。索葉圖告訴尹，康熙皇帝回京可能會讓妳我陷入險境，這都是珠兒和尹蘇的皇家姿態。
第465438集+0
康熙整頓吏治，命大臣彈劾違君大臣。康熙把彈劾珍珠等親信的寶座推給他們，對他們又好又親切。康熙命李光地即位，命其調查兩封匿名彈劾信，信中與太子勾結，密謀炮轟康熙和已被葛爾丹俘虜的尹。
第42集
康熙決定用親征來滅格爾丹，榮飛提議隨營隨行。孝莊皇太後認為寶日龍梅也應該參戰，並希望康熙能將藍綺兒帶回北京。張說，明珠在獄中還忙於公務，明珠聲稱自己有錯但無罪。
第43集
陳廷敬因病去世。張運糧到漠北，送別孝莊皇太後。小莊叫他去找蘇麻辣燙阿姨。蘇麻阿姨給康熙寫了壹封信，說她這輩子只真心愛過壹個人，那就是她的弟弟葉璇。
第44集
葛荔說服朱三王子秘密殺死康熙。康熙在草原上舉行宴會慶祝勝利，並與寶日龍梅在草原上遊泳，墜入愛河。包日龍梅回到了蒙古總部。太子朱三攻打康熙大營，全軍覆沒。康熙看到了戰死沙場的朱三王子和格裏。
第45集
康熙問殷屠弒君的事，殷承認曾與他密談過。康熙說以後不再提這件事。康熙廢了太子尹仁，尹仁在朝廷昏厥。榮飛反對用孝莊皇太後的遺產廢除太子。惠妃說，孝莊皇太後從來沒有這個遺產，康熙下令把榮飛拿下，剝奪她的身份。
第46集
《千喜宴》外，榮飛晚上洗廁所，最終被廁所壓死，但她的心是最幹凈的。比起那些為了政治利益而出軌的人，她壹點都不臟。康熙傷心內疚，降旨追榮飛為皇後。
魏東亭告訴康熙，想不到皇帝會讓這個太子做繼承人，然後他就病死了。朝廷之上，康熙正要宣布“建立後備軍”的遺願，卻突然死在龍的寶座上，結束了自己輝煌的壹生。(全劇結尾)