後來，當王導還是司空的時候，諸葛輝也在場。王導指著頭上的皇冠說:“妳就戴這個吧。”當時潁川人魯迅和人蔡默都以詞著稱，諸葛輝被稱為“中興三明”。有人說“京都三明有名，蔡飄逸，荀歌卿。”永嘉元年(307)，瑯琊王司馬睿任安東將軍，任命諸葛輝為主簿，後升任江寧縣令。
永嘉五年(365，438+065，438+0)，諸葛輝因周馥有功，封其為騎士。同年，司馬睿被提升為鎮東將軍，司馬睿提拔諸葛輝參軍鎮東。後來，諸葛輝和邊虎因為當時的名聲，被提拔從事中郎將和零陵文書的簿記事務。當時四方事多，奏章堆積如山。諸葛輝考慮了壹下，處理得當。當時王是大將軍，諸葛輝和都身居要職。劉超負責撰寫詔書，既忠誠又謹慎。當時人們認為皇帝善於任用人才。
建興元年(312)，晉武帝司馬曄即位，廣納賢才，任用賢才，延攬諸葛輝為朝中尚舒朗。司馬睿認為規劃和治理需要人才，所以他被雇用來留住他們，並根據皇帝的法令被調任為會稽知府。臨行前，司馬睿設宴款待了諸葛亮，對他說:“今天的惠濟就像過去的關中，兵多糧足，需要好的太守。因為妳有治理的天賦，所以委屈妳去了。今天，四方正在分崩離析，所以我們應該拯救正義，幫助危險。有什麽急事，請告訴我。”諸葛輝表示感謝，然後回答說:“在當今世界動蕩不安，風俗下降的情況下，我們應該提倡五德，摒棄四害，使用忠誠的人，擊退浮華的人。”司馬睿認為他說的很有道理。
泰興初年(318)，已經稱帝建立東晉政權的晉朝皇帝司馬睿上書說:“最近國家困難，官員頻繁變動，弊端較多。就算是聖人也要日積月累才能成功，何況別人！漢武帝宣帝說:“和我壹起定天下吧。”。只有兩千石的好官。“這種說法是真實的。因此，巴荒等人十年未調，有的二十年未調。這就是他能取得中興成功的原因。有起有落，這就是執政之道。諸葛輝，會稽內史，任職三年，為諸郡之首。他應該被提升官銜並增加工資作為獎勵。諸葛輝的薪水現在增加到2000石。”不久，諸葛慧因母親去世而服喪辭職。服喪期滿後，他被任命為秘書。王敦在上表中任命諸葛輝為丹陽尹，因久病不愈被免去職務。
泰寧二年(324)，晉明帝司馬紹攻克王敦，任命諸葛暉為其助手，並加他為校尉。諸葛輝後來因征伐越王而獲得建安伯爵位，並把原來的爵位讓給他的次子諸葛鯤為山海關侯。他還任命諸葛輝為後將軍和文官。後來，諸葛輝被征入朝任輔佐，後歷任左敏尚書、武陵王師、吏部尚書、尚書右仆射、石三常侍、尚書令等職。
鹹康八年(342年)六月，晉城皇帝司馬燕病重，命諸葛輝、武陵王司馬Xi、惠濟王司馬昱、中書令監於兵、中書令秘書何沖為輔佐朝廷事務的大臣。不久，晉城皇帝死了，晉城皇帝和他的母親和弟弟王司馬嶽壹起為晉康皇帝繼承了王位。晉康帝即位後，任命諸葛輝為輔佐大夫，晉子光祿。
永和元年(345年)五月，諸葛輝去世，享年62歲。朝廷追授他為左光祿博士，易通三秘。喪葬費給的對象都是按照秋廬的老做法。祭拜謚號。獄中犧牲。