存活試驗品
鳴人在忍者學校第三次畢業考試失敗。老師水木利用鳴人偷了禁書，陰謀被前來救鳴人的同事伊魯卡識破。鳴人在《禁書》中使用了多個化身，從而打敗了水木。伊魯卡老師允許他通過考試並畢業。從學校畢業後，鳴人和8名同屆畢業生(宇智波佐助、木本櫻、、亞、直乃、伊諾、丁基、鹿丸)正式成為了任俠，並被分配到任尚卡卡西擔任隊老師，屬於第七隊。卡卡西給了三個人壹個鈴鉆，鳴人各自為戰，最後慘敗。佐助意識到老師希望他們有團結的精神後，終於通過了生存考驗。
海浪王國
鳴人正式成為任俠後，壹直從事D級以下的任務，比如找寵物、清理河流等。鳴人自己也有些抱怨。最後他們被分配到護送重要人物的C級任務，內容是安全護送橋梁建築師達茨納先生回波蘭。在卡卡西的帶領下，他們陪著達斯勒先生出發了。然而，在路上，我遇到了兩個來自五音村的任重。鳴人很害怕，因為他從來沒有實戰經驗。相反，佐助和木本櫻很冷靜，佐助敏捷地制服了兩個任重，等著卡卡西對付他們。然後他們遇到了壹個更強大的敵人——帶著匕首的叛逆的桃地再不斬。卡卡西被水牢術困住的時候，鳴人配合佐助使用了附魔者手裏劍？影風車會把偽裝成苦難的鳴人扔出去，解開永遠不再切割卡卡西的束縛。卡卡西再次戰敗後，指導鳴人、佐助、木本櫻如何控制查克拉。鳴人和佐助互相競爭，最後達到樹頂。明人在登上了壹個家，波濤之地；同時，他也認識了壹個神秘而美麗的男孩，白。
不久，這位昔日的假日亡靈再次出現，對第七班進行報復。和白同時出場的，是和有血限的佐助對戰。白用秘技？魔鏡裏的冰晶把佐助困在裏面。此時，鳴人擊敗卡多並想綁架伊那裏的兩個手下後，不顧壹切地沖進了白色陷阱。佐助只能用新開啟的血界“沙林甘”來應對白的行動，同時掩護重傷的鳴人。白利用了這個弱點，試圖攻擊鳴人，以迫使佐助露出破綻。佐助知道這是壹個計劃，但他用自己的身體罩住鳴人，嚴重摔倒。鳴人以為佐助被殺了。他很生氣，用的力量打敗了白。當白色的面具脫落時，明仁知道他是他曾經認識的那個美麗的男孩。白承認失敗，並要求鳴人殺了他。但白虎覺得宰布克有危險，向鳴人道歉後離開，為宰布克擋住了卡卡西的致命壹擊。鳴人得知白的死訊後，把白的忠誠和友情告訴了看似冷漠的宰不劍，讓鐵漢宰不劍哭了。如果妳不再砍，妳會反過來殺死邪惡的卡多，但代價是妳自己的生命。佐助很快從昏迷中蘇醒過來。七班順利完成任務，準備回木葉村答辯。為了感謝鳴人的幫助，泰沙先生特地將新修的橋命名為“鳴人橋”...
忍耐的檢查
博國使命後，明人回到木葉。此時木葉即將舉行忍之審判，來自四面八方的忍之聚集在木葉，準備接受審判。鳴人、佐助、木本櫻最終決定參賽。第壹輪是筆試，也是鳴人人生最苦的壹道題；好在考官Ebiki其實是想測試壹下考生的心理，所以鳴人雖然壹個問題都沒答，但還是順利通過了考試，被Ebiki認為挺有意思的。
第二輪是生存試煉，與死亡之林的其他候選人爭奪天卷軸和地卷軸晉級。途中遇到了喬裝成曹仁候選人從木葉叛逃的大蛇丸。佐助曾經害怕大蛇丸召喚的大蛇，所以在鳴人反目之前，依次鼓勵佐助加油。佐助最終以巧妙的身手制服了大蛇丸，但大蛇丸卻在他的脖子上留下了天譴，他痛得昏了過去。鳴人也被大蛇丸的五行封印封住了，九尾的力量也被封住了，暈了過去。木本櫻不得不壹個人照顧佐助和鳴人。然而沒過多久，他就遇到了殷人拓、薩克、秦(又譯金)。木本櫻壹個人無法反抗，被小李、陸丸、丁基和葉靜救了出來。佐助也突然爆發了天譴的可怕力量，擊退了音忍。鳴人和佐助醒來後，繼續考試，但考試時限將至，仍然缺少所需卷軸。感謝之前認識的學長藥師兜的指導，我決定在終點塔等待其他考生，擊敗三名於人成功拿下卷軸。
第三次考試分為預賽和淘汰賽。鳴人的初步對手是犬冢牙和他的隱忍狗赤丸。犬冢牙的獸人分身，牙齒被打穿，這讓鳴人處於劣勢。但是鳴人巧妙的使錯手重傷了自己的隱忍犬赤丸，並且因為突然放屁嚴重影響了牙齒的攻擊能力，被鳴人自創的鳴人擊敗。在淘汰賽中，鳴人遇到了被稱為“天才”的日向寧次。寧次的回天術，點穴術，八卦六十四掌更是出乎意料。鳴人沒有力氣動紀寧壹根頭發，甚至被他的穴道封住，所以他無法使任何查克拉。但由於考前“三忍”之壹的自來也得到指示，得以駕馭九尾的實力，以九尾的實力擊敗紀寧，受到全場歡呼。
考試快結束的時候，佐助突然遭到沙人和殷人的攻擊。因為佐助急著追上對手我愛羅，卡卡西命令鳴人、木本櫻、鹿丸阻止佐助的瘋狂舉動。途中，鹿丸減緩了後面追來的八個人的速度，鳴人也追上了佐助，卻發現和佐助對戰的我愛羅變成了另壹個怪物的臉，俘虜了木本櫻。鳴人拋開恐懼，用鳴人的兩千發彈和壹千年殺把我的愛打得體無完膚。後來愛羅被進壹步改造成了壹個完整的“壹尾”，鳴人也召喚出了已經約好的波多野夫人，然後混合改造成了壹只狐貍，抓住了“壹尾”。鳴人喚醒了正陷入沈睡的吾愛羅，讓“壹條尾巴”的力量受到壓制。最後鳴人狠狠壹拳，把我打得倒在地上不能動彈，成為唯壹打敗愛我的木葉的忍者。木本櫻和佐助獲救了，而我的愛人羅則被姐姐特瑪麗和哥哥護送走了。他們回到木葉後，收到了第三代霍穎去世的噩耗...
三忍決戰
第三代霍穎已經失去了生命，它的地位已經被暫停。卡卡西在對付突然襲擊的蕭成員時，也被自己的幻術迷住，身心受盡折磨，需要在醫院裏長時間等待；佐助也被雪貂打傷了。於是，自來也決定帶著鳴人壹起去找精通醫術的“三忍”之壹的綱手姬。此行的目的不僅是邀請她治療卡卡西和佐助，也是邀請她回來接替霍穎的職位。在這次旅行中，自來也成為了著名的道教忍者，“螺旋丸”，這是由四代霍穎創造的，不需要印刷。後來偶然在短書街酒館遇到姬和她的助理，對方卻對鳴人成為鳴人的夢想嗤之以鼻，讓鳴人感到不滿。喜歡賭博的綱手姬還和鳴人打了個賭，如果對方能在限定時間內學會螺旋丸，就送他壹條屬於第壹代遺物的項鏈。鳴人也毅然答應。
但很快大蛇丸也找到了綱手，試圖引誘她治療自己已經被三代拋棄的手，但沒有成功；於是大蛇丸決定采取強硬措施。大蛇丸和藥師兜把綱手引到了山頭，利用綱手怕血的弱點，成功癱瘓了她的攻勢，被拳打腳踢。幸好和鳴人及時趕上，鳴人也用自己的額頭替擋住了竇的拳。鳴人甚至用計劃鎖定了Pocket的攻勢，和暗影《阿凡達》壹起施放了螺旋丸，攻擊Pocket的胸部，將Pocket撞向了壹塊巖石。不過鳴人也傷到了內臟，所幸沒有生命危險。綱手很感激鳴人的保護，並驚訝地在短時間內學會了螺旋丸。他決定重新站起來，克服他對血液的心理障礙，與大蛇丸戰鬥。傳說“三忍”自來也、綱手姬和大蛇丸互相爭鬥，分別召喚出各自的召喚師。大蛇丸被強大的綱手打敗了。見勢不對，與竇同走。三忍大戰結束，綱手姬終於被鳴人打動，決定以鳴人的身份回到木葉，並按約定把原來的項鏈給了鳴人。綱手把所有的希望都托付給了鳴人...
佐助救援篇
經過之前的任務，佐助深深的感覺到自己的實力不如鳴人，但是他嫉妒，想要追求更強大的力量為哥哥宇智波鼬報仇。此時，在大蛇丸成立的殷茵村四名忍者，綽號“殷茵四人”，誘使佐助叛逃至殷茵村，佐助也準備反叛木葉。佐助臨走前還把前來勸他的木本櫻給打暈了。木葉雖然收到了佐助叛逃的信息，但是之前受到了沙人和殷人的攻擊，所以無法增派人手追捕。鳴人得知後深感震驚，決定追回佐助，在村裏找壹個信得過的夥伴參與任務。最終，由奈良鹿丸、鳴人Uzumaki、日向寧次、秋道丁次和犬冢牙組成的團隊將執行這項任務。臨行前，鳴人向木本櫻發誓，壹定會把最愛的佐助帶回木葉。然而，在途中，我們遇到了“殷瑛四人組”的阻撓，夥伴們也獻出了生命，讓鳴人追上佐助。但是突然，君麻呂，這個血隨極限的克星，出來了，這超出了原來的計劃。鳴人試圖讓千影打敗君麻呂，但對方壹點損傷都沒有；幸運的是，傷愈的李洛克及時幫助了他，他可以繼續追趕佐助。
最後，具有諷刺意味的是，他們在霍穎和宇智波馬達拉之間的決鬥結束之谷相遇了。鳴人問佐助為什麽不珍惜他們的友誼。佐助的回應指出，友誼固然重要，但並不能讓他變得更強。他需要的是更強大的力量。鳴人無奈，只好用強硬手段逼佐助回歸。佐助開啟進化後的sharingan與使用九尾力量的鳴人戰鬥。最終，進入第二個咒文並使用了千鳥技能的佐助打敗了使用了九尾之力和螺旋丸的鳴人。大局已定，鳴人無法再追蹤佐助，這也將是鳴人心中長久的遺憾...他倒在地上昏了過去，被大雨撒了壹身；直到卡卡西趕到，鳴人才被帶回木葉治療。這件事之後，鳴人決定自己修行，跟著自來也去外面修行...
第二部分
風影救援物品
在自來也訓練了三年後，鳴人回到了木葉。此時的他，在身體和心理上都比兩年前更加成熟。鳴人並沒有氣餒，反而在得知壹群朋友變得隱忍或忍讓，我更愛羅的時候，受到了鼓舞。後來，兩個“小”的不速之客在晚上突襲了沙隱村。我愛羅是因為我要照顧沙仁村的居民，結果被打敗了。勘九郎為了救他的兄弟也被毒死，沙隱村陷入混亂。知道我愛羅被抓，他也下定決心要去營救，作為壹個力量的支柱，正是因為鳴人很清楚我愛羅在孤獨的痛苦中。他以前嘗試過孤獨，但現在有了自己的伴侶；相反，我雖然為風影而愛羅，卻依然飽受鄉親們的偏見和冷落。他堅持把我的愛從孤獨和危機中拯救出來！鳴人的決心也打動了沙音村退休老兵千代的心，決定回來幫助鳴人拯救我的愛情。後來我到了“小”的見面地點，但是已經來不及了。我的愛人羅被拖出了，死了。鳴人為了奪回我愛羅的身體，受到攻打沙隱村的蕭派成員的挑釁。卡卡西不放心，就和鳴人壹起去，勸鳴人冷靜下來，詳細商量。鳴人與卡卡西合作，卡卡西用萬花筒般的沙林甘傷害了迪達拉，然後鳴人擊落了迪達拉騎著的巨鳥，拿回了艾羅的屍體。後來證實我愛死羅輯了，鳴人變成狐貍襲擊了迪達拉。卡卡西看到了，立刻用自來也說的方式阻止了鳴人。迪達拉被木葉三班和七班圍攻，逼老虎跳墻用爆法，看似同歸於盡。幸運的是，卡卡西轉移到了另壹個空間...戰鬥結束後，我愛羅的屍體躺在草原上，鳴人的真摯友情感動了千代婆婆，她願意犧牲自己的性來命令我復活。我喜歡羅的歸來，沙隱村的人們在街道兩旁歡迎他。第壹次愛羅，感覺被別人肯定。故明人欲歸，我愛羅，心存感激；雙方的握手代表永恒的友誼...
天地橋之戰
從小蠍子口中得知他將與派往大蛇丸的臥底會面，他認為這是尋找佐助消息的好時機。第五代項目獲批，我們準備出發去會場——天地橋。由於卡卡西在壹戰中與迪達拉相處時間過長，前秘密部門成員、化名大和的天藏擔任了新隊長，帶領鳴人、小櫻和新成員賽前往目的地。鳴人和小櫻雖然不喜歡賽的假笑和口無遮攔的話，但壹致認為為了佐助，他們願意和不喜歡的人合作。到達天地橋後，大和將自己偽裝成蠍子並聯系了蠍子的臥底，鳴人則躲在巖石後面等待指示。令他們驚訝的是，這個臥底竟然是藥師兜。之後大蛇丸也出現了，大和的偽裝身份暴露，雙方開戰。鳴人被激怒，變成了壹只四尾狐，失去了意誌，傷害了木本櫻。大蛇丸和鳴人之間爆發了壹場激戰，被竇稱為“妖怪之戰”。大蛇丸之後，因為三年期限到了，身體承受不了，不敢繼續打了；鳴人也被大和控制尾獸的力量所壓制，回到了人類的狀態。醒來後，很後悔得知自己傷害了小櫻，但我贊同大和的說法，應該不斷鍛煉自己的力量，保護身邊重要的人。
再次見到佐助
壹戰後再次見到佐助天地橋，明人繼續追查大蛇丸的追隨者，才得知賽背叛了他們。此時，大和的木分身已經摸清了大蛇丸的老巢位置，明人決定深入老窩。他們首先找到賽，把他綁了起來；賽問鳴人為什麽堅持要救佐助，鳴人說是因為他和佐助之間有兄弟般的情誼。賽被它感動了，想親眼看看“羈絆”的含義，終於拋棄黑暗，投下了光明，反過來合力制服了新來的藥師兜。鳴人和賽冰釋前嫌，聯手在大蛇丸的老巢尋找佐助的下落。沒想到又遇到了大蛇丸，鳴人讓賽先去找佐助，自己去對付大蛇丸。小櫻和大和來幫忙後，大蛇丸又消失了。鳴人從賽臨走時留下的秘密計劃中發現，賽此行的目的是刺殺佐助，他們不禁又擔心起來。突然壹聲巨響，引起了明人的註意，他們急忙趕到現場，卻發現賽站在那裏。突然傳來熟悉的聲音，我看到爆炸後地上站著壹個人。是佐助！！再次遇到佐助，鳴人壹開始很興奮，但佐助冷漠的態度和敏捷卻出乎意料。佐助說他會殺了鳴人來打破他們之間的“羈絆”。還說剛才賽說要帶他回木葉找鳴人。奇怪的是，大蛇丸和再次出現，他們阻止佐助殺死鳴人，以便留下鏟除蕭的力量。佐助不再執著，帶著大蛇丸離開了...救佐助的目標又失敗了，但他得到了真誠的夥伴賽...
飛段和焦度文章
鳴人回到訓練中，得到了卡卡西和大和的指導。鳴人知道自己的能力屬於“風”屬性。為了加快訓練效果，他用多重陰影分離法進行練習，還去同樣具有風屬性的猿飛阿斯瑪求教。阿斯瑪在飛段和焦度戰敗被殺後，第十階級想要復仇。卡卡西暫時把練習留給了大和，自己照顧十班。卡卡西之後，卡卡領導的第十班與飛段和焦度進行了激烈的鬥爭。幸運的是，大和帶領鳴人，賽和櫻及時趕到加入戰團，鳴人和大和使用風水混合技術“颶風和漩渦的技術”來抵消風和火在焦度的混合攻擊。鳴人用新技能風盾螺旋手裏劍攻擊焦度，但是第壹次失敗了。卡卡西認為圍攻焦度是合適的，但隨著鳴人超越四代霍穎的決心，卡卡西要求鳴人進行第二次進攻。鳴人也不負眾望。他成功地用自己的影子欺騙了焦度，並從背後施了壹個風遁螺旋手裏劍，給了致命壹擊——焦度全身經脈被震碎，摔倒在地。魯丸也打敗了飛段後，他們回到了木葉忍耐力村...
宇智波亨特佐助
為了得到已知的信息，追尋佐助的下落，木葉決定鎖定以宇智波鼬為目標的追擊計劃，而鳴人的大和班和卡卡西的新首領8班聯手。在路上，鳴人的影子分身曾經遇到過宇智波鼬，臭鼬當時有話想對鳴人說，可惜話題被鳴人的沖動打斷了。但臭鼬在離開前給了鳴人神秘的力量，並說只有在必要的時候才會使用這種力量，等等。之後大家都和內廣對決，但是鳴人的螺旋丸，智奈的蟲玉，開齒術都無效。這時，小覺來報告佐助和雪貂的戰果。佐助的勝利和戰後的慘重損失讓鳴人感到驚愕和擔憂。他曾稱絕覺為“蘆薈”，要他說出佐助在哪裏。收到信息的小隊停止了戰鬥，壹起去戰場把雪貂和佐助的屍體帶走。鳴人急忙追趕他們，雖然他們發現了戰場位置，但他們已經空了...
佩恩襲擊了木葉
在沒有再次找到佐助後，我回到了木葉，但我震驚地聽到自來也被佩恩殺死了。為此，他壹度很難過，但在伊魯卡老師和盧馬魯的鼓勵下，他重新站了起來，並幫助解開了自來也生前留下的密碼。不幸的是，他仍然沒有線索。為了給自來也報仇，他決定接受神作的建議，去自來也曾經練習過的廟木山進行艱苦的魔法訓練。在訓練中，鳴人變成了壹只青蛙。還好被大人制止了，但是鳴人全身都是傷。經過壹番練習，鳴人終於掌握了自然力，於是建議成年人改用無蛙油練習，同時送給鳴人自來也的最後壹部作品《安百裏人傳》。後來在和鳴人進行融合訓練的時候，鳴人被九尾狐貍拒絕了，但是鳴人想出了壹個不融合的辦法(就是壹次在兩個地方吸收自然能量)。另壹方面，木葉村正在被佩恩摧毀。綱手作為五代霍穎召喚鳴人回來，同時通過通靈獸蛞蝓展開了對村莊的營救。卡卡西和天道佩恩被力戰擊敗，在過度使用神威(為了救丁基)後，查克拉最終在過度使用後死去...在木葉村被佩恩摧毀的那壹刻，石馬(馬誌飾)的仙人用通靈術將仙人鳴人和神作、蛤蟆、蛙劍、蛙光、蛙姬召喚到木葉身邊，鳴人巧妙利用兩道影子補充神力，使出了新術。但實力始終不如天道，天道先後用“羅天正”和“萬象尹田”打敗鳴人，殺死神作。鳴人質疑天道這麽做的原因，天道也向鳴人透露了自己的目的...少年田為了營救鳴人被天道重傷，鳴人壹怒之下爆發出的力量，露出了自己的第六條尾巴和的骨頭。天庭的特技神羅天正和萬象天庭對鳴人來說完全無效，他只好逃到村子裏偷偷使用他的隱藏特技——“爆星”的禁術。面對爆星，鳴人八尾爆發。就在鳴人即將露出第九尾(撕掉封印九尾的咒語)的時候，四代鳴人突然出現在鳴人的意識中，攔住了鳴人。鳴人知道自己是四世同堂的兒子後，情緒激動。四代相信鳴人能夠保護木葉並幫助鳴人修復封印。九尾瞬間消失了，鳴人回到了不朽模式。經過壹番苦戰，他終於用螺旋丸打敗了天庭。鳴人找到了長門真實身份的所在地。經過壹番交談，長門被感動了，並相信了鳴人。他用“輪回”的禁術拯救了整個村子(包括卡卡西)。牡丹帶著和(天)的屍體回到村，離開了蕭。與此同時，恢復後的佐助帶領“鷹”隊為木葉做準備。疲憊的鳴人回到木葉，受到村民的歡呼。與此同時，火國召開緊急會議。由於綱手查克拉過度昏迷，火國大明決定選舉新的霍穎。雖然奈良鹿久推薦了卡卡西，但大明最終任命團藏為第六代霍穎。從來沒有告訴現場佩恩失敗的消息。
佐助大戰五影
佐助和雷英相遇，各方實力相當，佐助重傷。雷英使用了最後壹招，但被佐助擋住了(使用天空照片，佐助可以改變天空照片的形狀)，雷英失去了左臂。鳴人，卡卡西，大和與斑見面，斑講述了鳴人佐助的隱忍(不願放下仇恨)和雪貂的故事，並承認自己就是斑，鳴人很痛苦。賽代鳴人向木本櫻告白，鹿丸告訴木本櫻如果不行就殺了佐助(因為勸也沒用)，木本櫻同意了。與此同時，在佐助和的另壹邊，我愛羅，還有和她的妹妹也在這裏。我愛羅，想勸佐助。佐助說他不能回頭。我愛羅，愛哭。這三個人和雷英的人民壹起對抗佐助。佐助用了超S無敵忍術“能幫”。香菱找到團藏，佐助去找團藏。團藏逃走了，佐助繼續追。水影阻止了他，並開始戰鬥。然後土英也加入進來，佐助暈倒了。斑點出現了，向五影透露了“月亮之眼工程”(團藏除外):除了九尾，還有九尾情結十尾！六道仙人存在並留下了壹塊石碑。他曾經將十尾和查克拉封印在自己體內成為十尾中的支柱力量，而本體則被封印在有著爆炸之星的月亮中。當他死的時候，他把十個尾巴和脈輪分成九個，變成了九個尾獸。斑他打算收集所有的尾獸，讓被六道仙人封印在月球上的十尾復活，自己成為十尾的支柱力量，然後把自己的瞳力放在月球上施展“無限月讀”，用來控制天下所有人，統壹天下，創造“和平”。由於五大電影不同意交出八公和九尾的實力，阪本宣布第四次忍者戰爭向五影爆發。鳴人和五影能阻止這場戰爭嗎？！
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