熱振寺現占地約1.600平方米，全寺坐北朝南。寺廟中的主要建築包括左欽殿和熱真張拉。左欽殿建築面積660平方米，內設佛堂和佛堂。大經堂主要用於各種佛事活動，周圍有幾個小經，裏面供奉著佛像、經書等物。熱振張拉位於正殿的西面，是壹座三層建築。壹樓是倉庫，二樓是普通僧人的住所，三樓是熱真活佛的臥室和大殿。它的東、西、北三面被修道院圍成半圓形。
熱振寺有許多神聖的紀念碑。傳說修建大雄寶殿時，龍王呈上色瑪(金柱)和玉瑪(玉柱)作為殿內主柱；寺廟周圍有三萬多棵古柏，據說是鐘國巴加瓦乃的靈樹。傳說觀音菩薩曾在普陽崗秦山修行，成功後剃發成柏林，永不雕零。還有龍甘露泉和宗喀巴大師在寺後和尚格紮普(意為獅子山)寫下《菩提道學廣論》的草堂。