原來，特勤保障科是警察局的壹個特殊部門，是塞爾蓋設立的，從其他部門中分離出來，經常遭到嘲諷和諷刺。接受公眾的委托，為公眾服務。由於克勞斯貝爾特殊的政治因素，警察在辦案時經常遇到許多障礙，因此他們在公民心目中的形象並不好，公民傾向於向以服務和保護人民為宗旨的遊擊隊協會尋求幫助。因此，塞爾蓋在他已故的下屬蓋伊·班寧斯(故事開頭主人公羅伊德·班寧斯的哥哥，在壹次任務中犧牲)的建議下，成立了壹個特別任務支援科，希望挽回警察的形象。
塞爾蓋任命了四個人來清理克羅斯比下水道裏的魔獸，以此來測試他們的能力。在清理過程中，勞埃德等人意外救下了兩名不慎闖入下水道的少年，卻遭到了魔獸的攻擊。幸運的是，他們得到了克羅斯比最強的遊擊隊員亞裏歐斯·馬克萊因的幫助，他被稱為“風之大劍師”。
克羅斯比東南角有壹條老街，龍蛇混雜，有兩個不健康的團體，壹個是以高大兇狠的瓦魯多·瓦雷斯為首的“劍蛇幫”，另壹個是以長相帥氣但身手不凡的瓦吉·赫米斯菲亞為首的“聖書社”。兩個組織都聲稱對方襲擊了自己的成員，因此威脅要報復。為了防止發生交火，勞埃德壹行前去調查，發現這壹切都受到克羅斯比黑手黨“魯巴赫商會”的阻撓。
盧巴徹商會獲悉，壹個來自卡瓦德* * *和共和國的黑社會組織“黑月”來到克洛斯貝爾，為了保護自己的利益，希望挑起兩個無良集團之間的交火，在雙方失利後將其收編，以增強戰鬥力。勞埃德挫敗了黑手黨的陰謀，但同時他也逐漸意識到克羅斯比表面上的繁榮只是空中樓閣。
克羅斯比的彩虹劇團聞名世界。它有伊利亞·普拉提爾，掌管花旦，被譽為炎之舞。她意外地發現了壹個很有潛力的女孩毛，並邀請她加入彩虹劇團，與自己壹起排練她的新作《金太陽和銀月亮》。然而，在演出前，伊利亞收到了壹封神秘的恐嚇信，要求停止演出，信末署名“銀色”。莉夏·毛向特勤局支援科求助。勞埃德到達後，意外發現伊利亞是塞西爾最好的朋友，而艾麗是克羅斯比市長的孫女。
勞埃德等人著手收集線索，發現西爾弗是黑月雇傭的神秘殺手。就在我毫無頭緒的時候，我收到了壹封署名為“Silver”的神秘郵件。Tio發現發件人入侵了克羅斯比最大的銀行IBC的網絡來發送這封電子郵件。在艾莉的好朋友、IBC總統迪塔的女兒瑪利亞·貝爾的幫助下，Tio找到了郵件的來源，並找到了黑客Jonah。約拿書說他受銀子委托送信，銀子也留言讓他們在城外的觀星塔見面。
在星塔，勞埃德承認他查明尹不是發恐嚇信的人，尹委托特別任務支援科查明真相。恐嚇信事件交由警察局搜查部處理。勞埃德和其他人在表演期間秘密觀察，並會見了《克羅斯比時報》的記者格蕾絲·林恩。格蕾絲告訴勞埃德，市長秘書阿納茲涉嫌挪用公款。勞埃德猛然醒悟，意識到這是內斯特的陰謀，意圖轉移警方註意力，從而刺殺市長。勞埃德等人奮力阻止暗殺，並在抓捕內斯特的過程中發現了他非凡的機動性。
礦業城市美因茨的市長向特別任務支持部門求助，稱壹名礦工岡茲已經失蹤數天。勞埃德壹行發現，這個賭博壹向倒黴的礦工，壹夜之間在賭博方面進步神速，贏了壹大筆錢後，在克羅斯比過得很開心。大家的勸說都沒有結果。與此同時，克羅斯比也發生了很多奇怪的事件，事件的主角們突然能力大增。
黑月在克羅斯比的住所遭到魯巴赫商會的攻擊，損失慘重。勞埃德壹行詢問了黑月的負責人曹禮，發現只是魯巴赫爾將軍的崇拜者，但個個戰鬥力極高，壹手可扛重機槍。勞埃德深感不解，而美因茨市長打來電話，說岡茲在和人賭博，賭博過程中火藥味很濃。勞埃德和他的團隊趕到賭場，岡茲賭輸了。壹怒之下，他想發作。勞埃德和其他人發現岡茲在征服岡茲的過程中有很大的力量。
岡茲激烈反抗，在鬥爭中暈倒了。勞埃德壹行在他們的包裹裏發現了神秘的藍色藥丸。勞埃德和其他人覺得壹系列事件似乎有共同之處。為了找出這種藥物的成分，該小組向聖烏爾蘇拉醫科大學尋求幫助。Joyasim也是藥房的負責人，他給小組講了壹個故事，說這種藥丸似乎非常明智(真知),就像幾年前被消滅的邪教“D∴G”所用的藥壹樣。
西奧突然暈倒在醫科大學門口，塞西爾把他放在自己的房間裏。勞埃德等人從蘇醒的西奧口中得知，她已經被邪教帶走，充當了真智研制的活體實驗樣本。原來，很多年前，大陸西部到處都是消失的孩子，而教團正是為了發展真智(真知)，才把孩子作為活的主體。
由於失蹤兒童數量巨大，影響惡劣，最後在當地警察和遊擊隊的聯合打擊下，教團在各地的實驗據點被壹網打盡，教團成員要麽自殺，要麽精神失常。西奧在彌留之際被勞埃德的哥哥蓋伊·班寧斯救了出來，同壹個據點的其他孩子都因為不忍而早逝。回到特別任務支援科的總部，塞爾蓋對勞埃德壹行做了人道主義演講。原來他是總司令蓋伊·班寧斯和亞裏歐斯·馬克萊因兩位新警官的隊長，他們處決了邪教據點的人物。
勞埃德去盧巴徹總部調查，遇到了尋找教訓的達德利。幾個人發現龐大的黑手黨總部空無壹人。在突破了許多機關後，幾個人來到總統辦公室，找到了黑手黨販賣人口的真智(真知)證據。勞埃德甚至找到了他哥哥佩戴的警徽。勞埃德覺得事態嚴重，建議尋求遊擊隊協會的合作。達德利雖然不甘心，但還是同意顧全大局。
約阿希姆告訴了所有人真相。原來他是邪教的高級牧師，是邪教在各地實驗陣地的總負責人，也是真智(真知)的研發負責人。邪教否認太空女神的存在，研發壹種可以激發人的潛能，甚至提高運氣的藥物，確實是明智之舉。為此它采用多種手段在各地綁架、拐騙兒童作為實驗對象，收集威脅、刺激所激發的人類潛能的數據作為藥物開發。
由於影響巨大，最終在當地警方和遊擊隊的聯合打擊下被剿滅。所有的據點都被消滅了，約阿希姆躲起來收集了所有的實驗數據。因為邪教曾經設立了壹個名為“天堂”的據點，試圖反過來拉攏當地權貴，試圖抓住他們的把柄加以利用。因此，克羅斯比的議長哈爾特曼受到約阿希姆的威脅，要他幫助自己躲藏在克羅斯比，並建立他的秘密R&D中心。同時，他為自己的R&D和制作提供了大量的資金和設備。真是睿智(真知)。根據Joyasim的說法，選擇Klossbel的原因是它是壹個“聖地”，但沒有解釋原因。
另壹方面，基亞是上帝的兒子，自中世紀煉金術士時代以來已經存在和沈睡了500年，受到邪教的崇拜。kiya從沈睡中醒來，不知什麽原因被換成裝有玩偶的行李箱，被Lloyd等人發現。
勞埃德等人激怒了約阿希姆，把他打倒在地。約阿希姆施了壹個假的魔眼，囚禁了壹群人，但勞埃德騙他解決了。喬亞西姆吞下了壹整瓶知識，成為了壹個強大的魔人。被妖魔化的約阿希姆不僅攻擊力驚人，自我修復能力也很強。最後在殲滅天使淩的幫助下，勞埃德等人徹底擊敗了約阿希姆。
擴展數據:
遊戲背景-
克羅斯貝爾州位於塞梅裏亞西部。位於大陸西部，在赫裏博尼亞帝國、萊貝爾王國和卡爾瓦德共和國之間，70年前成為擁有自治主權的獨立地區，不隸屬於任何國家，擁有獨立的政治制度。市長和議會議長都有行政權，是分權的民主政治制度。
自治州首府為克洛斯貝爾市，西以貝爾加德門為界，毗鄰赫裏博尼亞帝國。東部以唐古拉門為界，與卡爾瓦德共和國相連。首都周圍有兩個村莊，分別是東北特產蜂蜜的阿爾莫利卡村和西北特產奇藥石的礦業小鎮美因茨。南部有雷米菲利亞公國支持建立的聖烏爾斯拉醫科大學，東南部有米蘇拉姆的栽培勝地和主題公園。
由於其地理位置和特殊的政治制度，克羅斯比自治州已成為中國大陸最好的經濟和貿易中心之壹。
近年來，雖然由於赫裏博尼亞帝國和卡爾瓦德合眾國的大規模軍事演習，空中變得非常緊張，但隨著《互不侵犯條約》在萊貝爾的簽署，這種緊張局勢得到了極大的緩解。於是，大量的資金、人力、智力從整個大陸流向此地，高樓大廈、制導車、制導電力網等嶄新的設施也相繼引入。
在壹個沒有軍隊的自治州，克羅斯比警察主要負責守衛市內的治安組織。他們暴露在來自帝國主義和民族主義國會議員的壓力之下，不僅面臨著各種腐敗，而且無法應對與議員相關的秘密猖獗的黑手黨組織和外國勢力的活動。因此失去了市民的信任，知名度也被遊擊隊協會拿走了。在這種情況下，為了重新獲得公眾的歡迎，成立了特別任務支助科。
特別任務支援科是勞埃德壹行被分配到的警察局中壹個新成立的薄弱部門。為了在公評中與遊擊隊對抗，支援科的職責就是處理來自世界各地的委托和要求，在警察局被視為“簽簽”“模仿遊擊隊的猴戲”。所以沒有人自願加入，成員都是有特殊情況的新人。