2006年8月20日，安樹新突然出現在河北保定清苑縣東閭村教堂，與不被教廷承認的愛國會主教蘇長山***祭壹臺彌撒，兩人均只穿神父祭衣。24日，安樹新獲釋。12月9日，安樹新又在東閭大堂主持蘇長山的追思彌撒。此後致力於龐大的保定教區地下教會（10萬人）同人數很少的保定教區地上教會（1萬人）的合壹和福傳，雖然受到阻礙，但在維護天主教教產，爭取政府尊重天主教上壹直在努力。現居於保定裕華路上的主教座堂。不過大部份地下天主教徒並不接受安樹新主教的作法。2007年升任保定教區助理主教。 2009年8月初，安樹新主教公開宣稱自己加入了愛國會，並擔任保定教區天主教愛國會的副主席。此舉使更多的神職人員和教友遠離了安主教。 2009年10月31日，聖座萬民福音傳播部發布關於安樹新主教的新聞公報，駁斥關於聖座萬民福音傳播部批準安樹新助理主教與***祭、並施壓讓安主教走出地下狀態，在愛國會登記註冊的說法為毫無任何根據。此公報發布後，引發了各方激烈的討論，天主教在線網站更認為這是萬民福音傳播部在推卸責任。2009年11月25日，天主教在線發表了對安樹新主教的長篇采訪報道，談及了與此事件有關的方方面面的問題，同時，安樹新主教也首次對外披露了自己的壹些心路歷程。2009年12月，意大利《30天》雜誌不僅翻譯了天主教在線對安樹新的采訪報道，還同時發布壹篇帶有嚴重歪曲性的評論。在激烈的爭論中，2010年2月10日，聖座國務卿致信給安樹新主教，除了轉達關註之情外，信函有兩個基本點，第壹點是對安樹新主教所做的（應該指其在愛國會任職）表示不贊同，稱“此類決定本應該避免”，然而，聖座國務卿也非常體諒安樹新主教的初衷以及所獲得的來之不易的能公開傳教的機會，說：“主教似乎最好不要主動放棄現有這種可以公開活動的可能”。對安樹新主教以後的選擇，信函也非常強調主教與梵蒂岡的溝通工作：“聖座將繼續關註這壹問題，壹旦出現重要新動向，將會以適當的指示幫助主教您。”（見信函第4號）第二點是對保定教區神職人員的期望，希望能借著教區神父們對主教的服從，成為教會有力的見證。（見信函第5號）此外，聖座國務卿還談到安樹新主教在呈遞給教廷的信件中的***祭問題，國務卿將***祭事件視為壹件首要涉及到良心的倫理問題，在缺乏自由的情況下，此類***祭事件不予置評，而就此了結。（見信函第3號）但2010年8月7日，爭論又開始升溫，肇因於安樹新主教接手中國天主教愛國會和主教團的任命而公開就職為保定教區正權主教，隨後，8月16日，保定教區不服從安樹新主教領導的神父們舉行會議，計劃選舉出壹位神父領袖繼續領導保定教區，追隨尚在坐監的蘇誌民（雅格）主教。