影響和危害雖然只是亮點，但是壹旦出現，簡直就是驚天動地的爆炸。這種增亮釋放的能量相當於654.38+萬到654.38+0萬次強烈火山爆發的總能量，或者相當於幾百億顆百噸級氫彈的爆炸；然而，壹次大型耀斑爆發可以在120分鐘內釋放出巨大的能量。耀斑除了太陽表面突然變亮外，主要表現在從無線電波段到X射線的輻射通量突然增加。耀斑發出的輻射範圍很廣，包括紫外線、X射線和伽馬射線、紅外線和無線電發射、沖擊波和高能粒子流，甚至還有能量極高的宇宙射線。
耀斑對地球的空間環境影響很大。太陽色球層發生爆炸，地球大氣層立刻出現余音。耀斑爆發時，當大量高能粒子到達地球軌道時，會嚴重危及航天器內宇航員和儀器的安全。當耀斑輻射靠近地球時，它會與大氣分子發生劇烈碰撞，破壞電離層，使其失去反射無線電波的功能。無線電通信，尤其是短波通信，以及電視和廣播都會受到幹擾，甚至中斷。耀斑發出的高能帶電粒子流與地球高層大氣相互作用，產生極光，擾亂地球磁場，產生磁暴。
此外，耀斑對氣象和水文也有不同程度的直接或間接影響。正因為如此，人們越來越重視對耀斑爆發的探測和預測，並試圖揭開耀斑迷宮的奧秘。
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