桐柏山還是南北氣候的過渡地帶，兩大水系的分界線。既有北方雄偉的群山，又有南疆秀麗的風光。所以這裏奇山異石眾多，山泉瀑布隨處可見，植被完好，各種動植物眾多，南北交匯，相互滲透。據調查，有脊椎動物33目76科326種，其中有33種被列為國家重點保護的珍稀動物，如金錢豹、金雕、水獺、果子貍、麝、白冠雉雞、大鯢、穿山甲、青羊、紅翅杜鵑等。它具有良好的過渡帶森林生態系統，南北植物區系兼容。被稱為中原地區獨特的天然生物物種基因庫和天然博物館，天然植被成為景區獨特的景觀。
這裏有許多古樹名木，其中有100多棵古樹，如柏樹、銀杏等，樹齡都在1000年以上。特別是清泉寺現存的千年銀杏樹，為中原之首，並有雍正十壹年豎立的石碑。碑上寫著:“清泉寺，壹座古老的寺廟，其寺前銀杏挺立，千年之遙。看它的情況，四面環山，樹木成蔭，鳥語花香，竹林茂密……”。目前，該樹的樹幹周長為9.8m，基圍為11m，樹高為27.5m，冠幅為25.5m..