宋紹興十年(公元1140)，揭陽縣遷址，正是法山禪師創立揭陽雙峰寺的那壹年，成為城中叢林。原址位於揭東縣桂嶺雙山南麓(古稱攀西都)，後山兩峰並立。頂上有壹塊高60尺的天然巨石，名為“石母”，周圍景物眾多，曾被稱為“兩峰八景”。寺廟規模宏大壯觀，與潮州開元寺、潮陽靈山寺並稱潮州三大名剎。每逢祈福節，城裏的官員、士紳越多，到山上沐浴拜佛的人就越多。從官道到離廟三裏的“頂蓋山”，下馬走進廟裏，以示虔誠。民間傳說，紹興十年重建揭陽縣時，地理學家認為“蚯蚓”從蓮花山龍頸到雙山，以***99為頂峰，再往東是平川，玉嬌村是“氣場之鐘”。於是，作為第99峰的石木山成了風水寶地，雙峰寺由此而建。它是古代揭陽文化的綜合沈澱。
雙峰寺在歷代屢廢屢興。司書:六月(1728)，雙鳳寺毀於壹場颶風，瓦全可用。知縣陳叔之主持了修復工作。民國14年，陳知縣廢之，廟宅作為教育經費。沈怡林存厚、林忠良和巨波小學發起籌款贖回祈福。20世紀50年代，寺院僧侶實行“農禪並舉”政策，以寺院區分工廠。文革期間，佛像和文物遭到破壞。
改革開放後，縣人民政府實行宗教政策，決定修建雙峰寺，恢復古跡，開辟旅遊景點。1986 10 10月25日舉行了奠基儀式，破土動工。經過整整61個月的建設，耗資400萬，建築面積2400平方米。19910+02 10隆重舉行了竣工儀式和佛像揭幕儀式，盛況空前。