漩渦鳴人是日本動漫《火影忍者》的主人公，第四代火影波風水門和第二代九尾人柱力漩渦玖辛奈之子。出生時父母為保護木葉忍者村，將強大的尾獸——九尾（九喇嘛）封印於鳴人體內後犧牲。成為孤兒的他在冷眼與孤寂中長大，但他的老師海野伊魯卡認同了他，鳴人下定決心要成為火影，讓所有人都認同他的存在。正式成為忍者後，同旗木卡卡西、宇智波佐助和春野櫻組成第七班，壹起踏上了修行之路。成為自來也的最後壹位弟子，學會了父親自創的忍術螺旋丸，通靈出妙木山蛤蟆，煉就了仙術；阻止佩恩襲擊木葉後，終於擺脫村民的嘲諷，成為人人稱贊的木葉英雄，並在第四次忍界大戰中發揮著至關重要的作用。
出生
鳴人出生
漩渦鳴人是第四代火影波風水門和第二代九尾人柱力漩渦玖辛奈的兒子。
玖辛奈的預產期時，因為女性人柱力在懷孕期間，封印抑制尾獸的能量都去用來孕育胎兒，會導致封印減弱。於是三代火影將產房布置在村外，並由嚴密的結界和眾多暗部保護。三代之妻琵琶子與另壹位暗部女忍田路擔任接生，同時水門也陪護再側保護玖辛奈，確保封印不被解開。
玖辛奈有驚無險地生下了鳴人，水門為此高興地流下了眼淚。宇智波帶土用時空忍術穿透巖壁進入產房，瞬間殺害了兩位醫護人員後奪走了鳴人，並用卑鄙的手段強迫水門帶著救下來的鳴人用飛雷神之術離開了玖辛奈的身邊，而玖辛奈的封印尚未修復完成。
帶土用寫輪眼控制九尾沖破了封印。尾獸被抽出，得益於漩渦壹族的強悍體質，玖辛奈並未立即死亡。但隨即帶土操縱九尾攻擊玖辛奈，玖辛奈幸運地被水門救下。
水門夫婦為保護鳴人而犧牲
水門用飛雷神將極度虛弱的玖辛奈帶回家安頓好，玖辛奈抱著睡著的鳴人哭泣，水門換好衣服便急赴木葉村。而帶土先到壹步，將九尾用通靈術通靈過來，引發災難。三代火影組織人馬奮起抵抗，趕赴到現場的水門用飛雷神轉移走了九尾的虛狗炮。緊接著水門與帶土交戰，並憑借著出色的謀略分析出他的弱點進而擊退了他。隨後將正在準備發射第二發虛狗炮的九尾連同自己壹起瞬移到自己家附近，同時搶出玖辛奈和鳴人，準備將九尾再度封印。
玖辛奈用查克拉鎖鏈勉強將九尾捆住並制造出結界，但卻因身體已經達到了極限而吐血。鳴人被吵醒後哇哇大哭，她用無比溫柔的眼神望著鳴人說“對不起……鳴人，我不是故意……把妳吵醒的”。玖辛奈的覺悟，是用僅存的查克拉跟九尾同歸於盡。
最終水門做出了自己的選擇：毅然決定犧牲自己的生命，由自己來封印九尾，並將九尾的壹半查克拉以及自己和玖辛奈最後的查克拉壹並封印在鳴人身上，讓夫妻倆都能夠在鳴人體內陪伴著鳴人成長，並設定封印程序使他們能在最關鍵最危急的兩個關頭給予鳴人幫助。
玖辛奈強烈反對水門的做法，認為其不應該就這樣犧牲自己並且還讓鳴人從小就背負如此沈重的負擔，而是應當活下去撫養和教導鳴人成長。水門明闡述自己的想法，說服了玖辛奈。水門先用屍鬼封盡封印了九尾的陰性查克拉，然後開始用八卦封印準備封印九尾的陽性查克拉。九尾發覺了水門的企圖，趁玖辛奈虛弱之際要殺死鳴人，但被水門與玖辛奈夫婦拼死擋下。玖辛奈在臨終之際含淚對鳴人訴說愛意。而這第壹次對孩子的愛的叮嚀，對初為父母的他們而言卻也成為了唯壹壹次。
最後，九尾被封印，水門和玖辛奈雙雙犧牲，去世前，玖辛奈將鳴人托付給了三代火影。
火影忍者
幼年時期
成為下忍前的鳴人(48張)
盡管水門和玖辛奈臨終前留下遺言，希望木葉忍者村的村民把鳴人視為村子的英雄，但出於保密，除了猿飛日斬和少部分了解內情的村民外，鳴人的身世並未對外公布，就連鳴人本人也不知道，村子裏的大部分人人都將鳴人視為九尾的化身，紛紛對他冷眼相待。也就是因此，鳴人壹直在孤寂中成長，然而他壹直想要得到別人認同，因此，他會在村內大搞惡作劇，吸引註意。他的惡作劇甚至嚴重到在木葉村的火影顏巖上塗鴉。[1]
晉升下忍
漩渦鳴人的招牌笑容
鳴人在忍者學校畢業試第三次失敗。水木老師利用鳴人偷竊禁術卷軸，陰謀被同僚伊魯卡看破，趕來救鳴人。鳴人利用禁術卷軸中的多重影分身擊敗水木。伊魯卡老師準他以此通過考試畢業。 在學校畢業後，鳴人與同屆8名畢業生（宇智波佐助、春野櫻、日向雛田、犬冢牙、油女誌乃、山中井野、秋道丁次、奈良鹿丸）正式成為下忍，鳴人、小櫻、佐助三人獲分派上忍卡卡西為帶隊老師，歸屬第七班。 卡卡西給三人進行鈴鐺演習，鳴人他們各自為戰，最終慘敗。後佐助悟出老師要他們有團結精神，打破卡卡西的規則餵鳴人吃飯，終於通過了生存測試。[2]
波之國任務
第七班合影
鳴人們正式成為下忍後，壹向從事的都是D級的任務，如找寵物、清潔河道等，鳴人本身亦有怨言。[3]終於他們獲派護送要人的C級任務，其內容就是要安全護送橋梁建築師達茲納先生返波之國。[4]在卡卡西帶領下，他們陪同達茲納先生出發。然而途中卻遇上了來自霧隱村的兩名中忍，鳴人因從未有實戰經驗，心有恐懼；[4-5]相反佐助及小櫻表現鎮定，佐助更以敏捷身手把兩名中忍制服。之後他們遇上更強的敵人——手持斬首大刀的叛忍桃地再不斬。當卡卡西被再不都以水牢術所困時，鳴人與佐助配合，用風魔手裏劍·影風車將偽裝成苦無的鳴人擲出，解開了再不斬對卡卡西的束縛。[6]卡卡西擊敗再不斬後，便指導鳴人、佐助和小櫻如何控制查克拉。鳴人和佐助互相競爭，最後均能達到樹頂。[7]鳴人們寄宿在波之國伊那裏壹家中；同時他亦認識了壹名神秘少年白。
第七班(3張)
不久，假死的再不斬再度出現，向第七班復仇。而白同時出現，擁有血繼限界的他跟佐助交手。白使出秘術·魔鏡冰晶，把佐助困在其中。此時，鳴人打敗卡多派來綁架伊那利壹家的兩名手下後，[8]匆忙趕到的他卻魯莽地沖進了白的陷阱。佐助唯有利用剛開啟的“寫輪眼”應付白的行動，同時掩護重傷的鳴人。白利用這壹弱點，攻擊鳴人以迫使佐助露出破綻。佐助明知是計，卻用自己的身體掩護了鳴人，身受重傷倒下。鳴人誤認為佐助被殺，憤怒之下使出了九尾的力量，擊敗了白。白的面具脫落，鳴人才知道他原來是先前所認識的那位少年。白承認已敗，請求鳴人殺掉他；然而白忽又感到再不斬處於危險中，向鳴人致歉並離去，並為再不斬擋了卡卡西的致命壹擊。當鳴人得知白的死訊後，向看似冷漠的再不斬講述了白對他的忠誠和情誼，讓再不斬這個鐵血之人落淚不已。再不斬因此犧牲了自己的性命，反過來把作惡多端的卡多殺死。而佐助不久亦從昏死狀態中甦醒過來。第七班順利完成任務，準備回木葉村覆命。達茲納先生為感謝鳴人相助，還特意把新築的橋梁命名為“鳴人大橋”。[9]
中忍考試
波之國任務結束後，第七班返回木葉。此時木葉正要舉行中忍選拔試，來自四方八面的下忍雲集於此，準備接受試練。鳴人、佐助及小櫻三人最終亦決定參加。第壹輪是筆試，亦是鳴人最叫苦的測試，碰上主考官又是暗部所屬審訊部長，徹底了解人類心理，擅於操控對方精神，被稱為“虐待狂”的森乃伊比喜。幸虧伊比喜其實是想考驗考生的心理，故鳴人雖壹條問題也沒回答，仍成功過關，還被伊比喜認為相當有意思。[10]
第二輪是生存試練，在死亡森林內與其他考生爭奪用來晉級的“天之卷軸”和“地之卷軸”。第七班途中遇上偽裝成草忍考生、已叛離木葉的大蛇丸。佐助對大蛇丸所召喚的大蛇壹度畏懼，故鳴人壹反之前，反過來以激將法使佐助振作起來。佐助終以巧妙的身手制服大蛇丸，卻被大蛇丸在其膊上留下天之咒印，痛極昏過去。鳴人亦中了大蛇丸的五行封印術，九尾力量被封印起來並昏過去。小櫻只得自行照顧佐助及鳴人。[11]但不久又遇上了音忍托斯、薩克及琴，小櫻無法自行抵擋，幸得小李、鹿丸、丁次及井野等人相救；佐助亦突然爆發可怕的天之咒印力量，把音忍們擊退。鳴人、佐助蘇醒過後，三人又繼續考試，但考試時限將至，始終仍欠缺所需卷軸。幸得之前認識的藥師兜指點，決定往終點之塔處等待其他考生，並擊敗三名雨忍成功奪取卷軸過關。[12]
第三場考試分預賽及淘汰賽。 鳴人的預賽對手是犬冢牙及其忍犬赤丸。牙的獸人分身、牙通牙等秘術壹度迫使鳴人處於下風；但鳴人卻巧使計令牙錯手重傷自己的忍犬赤丸，又因突然放了壹個屁，嚴重影響牙的攻擊能力，被鳴人自創的鳴人連彈所敗。[13]進入淘汰賽，鳴人遇上有“天才”之稱的日向寧次，寧次的回天、點穴術及八卦六十四掌更是出乎意料的厲害，鳴人連動寧次壹根汗毛的力量也沒有，甚至被其封印穴道，使不出任何查克拉。但因試前得到“三忍”之壹的自來也所指點，釋放九尾的查克拉擊敗了寧次，獲全場歡呼。[14]
擊敗我愛羅
就在考試步近尾聲之時，卻遭到了砂忍及音忍的突然襲擊，因佐助急於追趕自己的對手我愛羅，卡卡西便命令鳴人、小櫻及鹿丸務必阻止佐助胡亂行動。鳴人追上佐助，卻發現正在與佐助對戰的我愛羅已變成守鶴，還把小櫻給捕捉起來。鳴人撇開恐懼，使出鳴人二千連彈及千年殺，把我愛羅打至潰不成形。及後我愛羅進壹步化成完全體的“砂之守鶴”，鳴人亦召喚出蛤蟆文太，再混合變身為九尾妖狐，控制住守鶴。鳴人把正沈入睡眠中的我愛羅撞醒，使守鶴力量被壓制起來。[15]最後，鳴人壹拳痛擊我愛羅，使其倒在地上動彈不得，成為當時唯壹打敗我愛羅的忍者。小櫻及佐助獲救，我愛羅亦被其姐姐手鞠、哥哥勘九郎護送離開。他們回到木葉後，卻己收到第三代火影在與大蛇丸的對決中身亡的惡耗。[16]
三忍決戰
螺旋丸修行
第三代火影去世，火影的位置空著；而卡卡西在對付突然來犯的“曉”成員——宇智波鼬時，亦中了其幻術，身心備受折磨而需長期待在醫院；而佐助亦為鼬所傷。故此自來也決定帶同鳴人，前往尋找深諳醫術、“三忍”之壹的綱手。此行目的除了請其為卡卡西及佐助治療，亦打算邀請她回來擔任火影壹職。此行途中，自來也順道教鳴人新忍術——由四代火影自創，無需結印的忍術“螺旋丸”。[17]後來在短冊街酒館內偶然遇上綱手及其助手靜音，但綱手對鳴人成為火影的夢想冷嘲熱諷，使鳴人感到不滿。喜歡賭博的綱手亦跟鳴人打賭，如果對方能在限期內習得螺旋丸，便把頸上屬於初代遺物的項鏈送給他。鳴人亦毅然承諾。不久大蛇丸找到綱手，欲利誘她為其治療被三代所廢的雙手，卻不成功；於是大蛇丸決定采取強硬手段。但鳴人同時被兜傷及內臟，所幸沒有生命危險。綱手見鳴人這樣保護自己既感激，又為短時間內習得螺旋丸而驚訝，決定重新振作，克服對血的心理障礙，跟大蛇丸壹戰。傳說“三忍”自來也、綱手與大蛇丸展開對戰，又分別召出各自的通靈獸，大蛇丸敗在力量型的綱手之下。大蛇丸見勢不對，與兜壹同離去。三忍之戰告終，綱手終為鳴人所動，決定返歸木葉擔任火影，又按約定把初代的項鏈送給鳴人，把壹切的寄望都托付在鳴人身上。[18]
營救佐助
終結之谷的決鬥
經過前次的任務，佐助深感自己的力量還不及鳴人，而心生嫉妒，欲追求更強大的力量，以向兄長宇智波鼬報仇。此時來自大蛇丸所成立的音隱村、綽號“音隱四人眾”的四名忍者，勸誘佐助投誠音隱村，佐助亦為所動而準備叛離木葉。臨行前佐助亦把前來勸告的小櫻打暈。木葉雖收到佐助叛離的情報，但因之前受到砂忍及音忍的攻擊，百廢待興，只能派鳴人、鹿丸等人前去追捕，臨行前，鳴人與小櫻定下約定——把佐助帶回木葉。然而，鳴人壹行人途中遇上“音隱四人眾”分別的阻撓，而夥伴們亦豁出自己的性命讓鳴人追上佐助。但卻又突然殺出了擁有血繼限界的強敵君麻呂，超出原先計劃之外。鳴人試圖制造千個影分身以擊敗君麻呂，但對方絲毫無損；幸得受傷後初愈的李洛克和我愛羅及時相助，可繼續追趕佐助的步伐。
踏上修行的旅途
最終在終結之谷遇兩人展開決鬥。鳴人追問佐助為什麽不珍惜彼此之間的友誼；而佐助的回應卻指出友情雖重要，但不能夠讓他變強，他所需要的是更強大的力量。鳴人無可奈何下唯有使用強硬手段迫佐助回歸。佐助開啟進化了的寫輪眼，與使用九尾力量的鳴人對戰。最終由進入第二重咒印、使用千鳥之術的佐助，擊敗使用九尾力量及螺旋丸的鳴人。大局已定，鳴人已無法繼續追蹤佐助，這亦將成為鳴人心中長久的壹個遺憾。倒在地上昏過去的他，被大雨灑遍全身；直到卡卡西的到來，才把鳴人帶回木葉接受治療。[19]此事之後，鳴人決心修練自己，跟隨自來也在外修行。[20-21]
火影忍者疾風傳
營救我愛羅
重返木葉
跟隨自來也在外訓練兩年後，鳴人回歸木葉，他在體格及心智方面已較成熟。當得悉壹眾友人已成為上忍或中忍，而我愛羅更是成為風影時，鳴人並不氣餒，反而被激勵起來。綱手命令鳴人和小櫻壹起接受卡卡西的鈴鐺爭奪賽，兩人通過對卡卡西的充分了解奪到了鈴鐺。三人接受命令，重組第七班。[22]
卡卡西班收到緊急增援風隱的任務，三人到達“曉”聚會的地點尋找被抓去的我愛羅，但為時已晚，我愛羅已被抽出尾獸力量而死亡。鳴人欲奪回我愛羅的身軀，因而被曾襲擊砂隱村的其中壹名“曉”成員——迪達拉所挑釁。卡卡西不安心，故隨鳴人同去，並勸鳴人要冷靜下來。鳴人配合卡卡西，由卡卡西使出萬花筒寫輪眼擊傷迪達拉，再由鳴人擊落迪達拉所乘的巨鳥，取回我愛羅的身軀。後來證實我愛羅己死，鳴人情緒激動，九尾的查克
拯救我愛羅
拉外漏，形成妖狐外衣，攻擊迪達拉。卡卡西見狀，立刻用自來也的符把鳴人制住。[23]迪達拉被前來支援的第三班和第七班圍攻，迫虎跳墻下使出自爆分身溜之大吉，幸被卡卡西的神威轉移到另壹空間。戰鬥結束，草原上躺著我愛羅的屍首，鳴人所表現的真摰友情，感動了千代婆婆，甘心犧牲自己的性命用轉生之術令我愛羅復活。我愛羅回歸，砂隱村的民眾夾道歡迎，我愛羅第壹次感到被其他人肯定的滋味。故鳴人們準備回歸時，我愛羅心存感激，雙方的握手，代表著永恒的友誼。
天地橋之戰
天地橋大戰
從“曉”的蠍口中得知其將與派往大蛇丸身邊的臥底會面，認為是尋找佐助消息的好時機；在綱手批準下，準備往會面地點——天地橋出發。由於卡卡西在與迪達拉壹戰中虛耗過多，無法同行，於是由卡卡西的隊友原暗部成員、代號大和的天藏擔任新隊長，率鳴人、小櫻及新成員佐井前往目的地。雖然鳴人及小櫻對佐井的假意笑容及毒舌，沒甚好感，但為了佐助，即使要與不喜歡的人合作也心甘情願。到達天地橋後，大和偽裝成蠍，接觸蠍的臥底，而鳴人們躲在巖後靜待指示。令壹行人驚訝的是，原來這名臥底就是藥師兜。及後大蛇丸亦出現，大和的偽裝身份亦被揭穿，雙方交戰起來。鳴人受到挑釁，變成四尾妖狐，失去自我意識，誤傷小櫻。大蛇丸與鳴人爆發激戰，被兜稱為“怪物間的戰鬥”。後大蛇丸因三年限期已到，身體不能承受，不敢戀戰而去；鳴人亦被大和操控尾獸的力量所壓制，變回人類狀態。清醒過後，鳴人得悉是自己傷害了小櫻而十分內疚，但同意大和所說，要不斷鍛煉，用自己的力量去保護身邊重要的人。
再會佐助
天地橋壹戰後，鳴人等人繼續追蹤大蛇丸壹眾，卻得悉佐井背叛了他們。此時大和的木分身已查出大蛇丸巢穴的所在地，鳴人們便決定深入虎穴。他們先找到佐井，並將其困綁起來；佐井問鳴人為什麼執著於要拯救佐助，鳴人卻說這是因為他與佐助之間，有著兄弟般的“羈絆”。佐井為其所動，想親眼看看“羈絆”的意義，終棄暗投明，並反過來合力把剛到的藥師兜制服。鳴人與佐井冰釋成嫌，組隊在大蛇丸巢穴內尋找佐助的下落。
第七班再會
不料卻又遇上大蛇丸，於是鳴人讓佐井先往尋佐助，自己則應付大蛇丸。及後櫻及大和前來助陣，大蛇丸又再度遁去。鳴人們從佐井臨走時遺下的秘策中，赫然發現佐井此行目的，原來是要暗殺佐助，不禁又憂心起來。突然壹聲巨響，引起鳴人等人的註意，並急步趕往現場，只見佐井正呆站著。忽又傳來壹把熟悉的聲音，只見爆炸後地面上站著壹個人，正是佐助。
重遇佐助，鳴人首先是表現興奮，但佐助冷漠的態度及身手的敏捷卻出乎意料之外。佐助稱要把鳴人殺掉，以斬斷彼此間的“羈絆”；又道出剛才佐井說要替鳴人帶他回木葉之事。奇妙的是，大蛇丸及兜此度又再出現，竟阻止佐助殺鳴人他們，目的是要留下能鏟除“曉”的力量。佐助不再執著，跟著大蛇丸離去。救回佐助的目標再度失敗，但卻得到了真心的夥伴佐井。[24]
火之寺事件
九尾人柱力VS人造九尾人柱力
在奪回佐助行動失敗後的幾天，為了開發屬於鳴人的獨創忍術，卡卡西利用躺在病床上的時間，構思出可以讓鳴人在短期間內完成修煉的方法。鳴人開始展開修煉，第壹項是利用風屬性查克拉切斷樹葉，由於方法得宜，再加上阿斯瑪教授壹些訣竅，鳴人很快就成功的切斷了樹葉。
卡卡西班接到新任務：前往火之寺，協助處理盜墓者事件。沒想到還沒到達，脫隊行動的鳴人就察覺隱形墓地已遭竊，還因此被火之寺的空誤認為是盜墓者，兩人大打出手。進入火之寺。鳴人發現周圍人看空的眼神和自己童年時被別人排斥的眼神壹致，於是試圖揭開空身上的秘密。卡卡西班身陷於盜墓賊和馬設下的迷宮陷阱“有為轉變”之中，隊員各自分散。鳴人遭遇不風，對方試圖用“屍鬼接吻”吸走查克拉，但九尾查克拉量過大無法吸收，小櫻、佐井、空趕到，救出鳴人後暫時撤退。
朋友們對戰鬥勝利蘇醒過來的鳴人報以笑容
回到木葉村後，由於佐井受傷，他的位置由空暫代，鳴人試圖把空引薦給朋友們，不料空卻不領情，反而差點同牙和丁次打起來，在面見綱手時也因為措辭不當被壹拳打飛。和馬偷襲木葉，用結界封印住木葉村周遭。鳴人追趕刺殺綱手失敗的空，卻被不風攔下，不風似乎可以使用五種屬性的查克拉，令鳴人陷入苦戰，但他發現不風其實在戰鬥中不斷切換身體，並找到了她的弱點——頭發，最終擊敗不風。
趕到村外戰場的鳴人發現了空的真實身份——移植了九尾查克拉的人造人柱力，和馬接觸空身上的封印，使他進入第二階段尾獸化，糟糕的是鳴人體內的九尾查克拉亦與其產生***鳴，鳴人壹邊極力壓抑自己體內的九尾，壹邊拼命地戰鬥，終於成功地喚醒空的內心，戰鬥之後，鳴人等人送空離開木葉去旅行。
飛段、角都之戰
鳴人通過“切開瀑布”來訓練查克拉性質變化
鳴人重新投入訓練，並得到卡卡西及大和的指點。為加快訓練效果，他以多重影分身術進行修行，並前往同有“風”屬性的猿飛阿斯瑪處尋求指點。後阿斯瑪對上“曉”的飛段、角都，戰敗陣亡，第十班意欲報仇，卡卡西暫時把修行之事交給大和處理、而自己負責照顧第十班。後卡卡西所率的第十班與飛段、角都陷入苦戰，幸虧大和及時率領鳴人、佐井、櫻三人趕到，加入戰團，鳴人更與大和壹起使出風水混合術“颶風水渦之術”，抵消角都的風火混合攻擊。鳴人以新術風遁·螺旋手裏劍攻擊角都，但第壹次失敗了。卡卡西認為應對角都進行圍攻方妥當，但憑著鳴人要超越四代火影的決心，卡卡西讓鳴人作第二次攻擊。鳴人亦不負所托，以影分身成功欺騙角都，並從其背後施以風遁·螺旋手裏劍，給予絕命壹擊；角都倒在地上動彈不得，由卡卡西了結其生命。鹿丸亦把飛段擊敗並封印後，眾人又回到木葉忍村。
尋找三尾
與“曉”的戰鬥結束，角都的經絡系統被鳴人的新術切壞，最後以卡卡西用雷切終結其生命，而因為新術的關系使鳴人右手受傷，綱手告知卡卡西與大和其危險性，並禁止鳴人再度使用風遁?螺旋手裏劍，暗部飛鳥將大蛇丸巢穴消息通過信鴿傳給綱手。綱手接到消息，組織由卡卡西帶領，牙、誌乃和雛田組成的搜索班前往大蛇丸的基地，另壹方面大蛇丸準備派遣手下紅蓮執行計劃，紅蓮目賭了佐助打倒千人且衣服不沾壹滴鮮血起了妒心，大蛇丸覺得差不多該是將佐助占為己有的時機來臨了，大蛇丸派遣紅蓮和幽鬼丸壹同執行作戰計劃；五代火影綱手派遣大和，率領佐井、小櫻二人前往支援卡卡西小隊。
綱手下達新任務：“封印尾獸三尾，不許落入任何人手中；保護與尾獸能力有關聯的幽鬼丸”，由靜音領軍的封印小組開始發動用來捕獲三尾的結界四方封陣，並開始搜尋三尾的下落，兜打算利用幽鬼丸的力量讓三尾暴動，以便破壞木葉的結界四方封陣，而紅蓮因為控制三尾失敗，被激怒的三尾攻擊時，幽鬼丸為了救紅蓮而發揮了前所未有的力量並成功的讓三尾停止了動作。鳴人與紅蓮為了保護幽鬼丸，在與三尾對峙的過程中壹起被吞入了三尾的肚子裏。兩人為了尋找出口決定暫時休兵壹起合作，而後在幽鬼丸和木葉的夥伴們展開救援行動後終於救出兩人，兜利用幽鬼丸讓三尾失控，攻擊木葉的忍者結界，幽鬼丸因過度衰弱，由木葉的夥伴們治療之際，紅蓮終於真心感悟將衰弱的幽鬼丸帶走遠行。[25]
追捕宇智波鼬
為了得知曉的情報，及追尋佐助的下落，木葉決定鎖定以宇智波鼬為目標的追捕計劃，而鳴人的大和班和卡卡西新領的第八班壹起聯手行動。途中鳴人的影分身曾壹度遇上宇智波鼬，鼬當時亦有話希望跟鳴人說，可惜卻因為鳴人的沖動打斷了話題。但鼬臨走前卻賦予了鳴人神秘的力量，並說在必要時才用此力量等等。後眾人對上了“曉”的“宇智波斑”（宇智波帶土化名），鳴人的螺旋丸、誌乃的蟲玉及牙的通牙之術均對其無效；就在此時，‘曉’的絕前來匯報佐助與鼬的戰果，佐助的勝利及戰後受重創使鳴人感驚愕及擔心，並罵絕是“蘆薈”、要他說出佐助在那裏。收到情報的斑不再戀戰，及絕壹起前往戰場把鼬的屍體及佐助帶走。鳴人急步追趕，雖找出戰場位置，但早已人去樓空了。
保護六尾
鳴人、小櫻、大和和佐井壹起到土蜘蛛壹族拯救擁有壹族之禁術的少女小瑩，她因為體內藏有相當強大的禁術因此和人柱力壹樣受到族人的排擠。而她的師父，能用肥皂泡使出忍術的叛逃忍者泡沫也遭到追殺部隊的糾纏。大家先是試圖把小瑩體內的禁術取出毀去，但小瑩卻先壹步落入敵人之手。鳴人他們之後便和爭奪禁術的敵人出現極大沖突，最後鳴人將敵方首腦打倒。而小瑩的師父泡沫（六尾人柱力）也成功的用六尾的力量阻止了禁術的失控。最後小瑩終於被泡沫認可為弟子，並壹起離開村子去修行。但是泡沫卻在獨自壹人去和追殺部隊談判時遭遇培因，力戰不敵