《潮州誌·叢談誌》記錄有幾則宋明時其除妖魔鬼怪的事。如《焚廟絕兇祀》記宋政和間潮州通判沈造到任時聞有韓山神，須男女以祭。沈造即焚其廟、毀去神像，得巨蛇，殺之，兇祀遂絕。還有《殺妖蛇》壹則，記宋時潮州有壹佛寺內有大蛇被祀為神，前後到潮州為官者都祭祀它，有壹位太守不信奉它，逢天旱，當地人就說是太守不信奉蛇神所致，這位太守便到蛇神廟去祭拜，“大蛇蜿蜒出”，將他嚇得暴卒。時廣東經略安撫使胡穎聞此事，命令寺僧將蛇擡出來殺了，將寺毀了，又將寺僧判了罪。
最為人熟知的是明代有兩位潮州知府破除迷信的故事，都在上述誌書中記述。壹為王源除怪石，壹為郭子章驅獨鬼。宣德年間，王源任潮州知府，修建廣濟橋，時聞西湖山有二怪不作祟，壹為蟾蜍石，壹為人形骷髏石。王源不信有什麽鬼怪，命石工將石撲碎，“琢為廣濟橋用”，並書“潮州知府王源除怪石”勒碑於破怪石之處。石除怪也沒有了，可見原來所謂怪，都是謠言傳說。另壹位萬歷年間知府郭子章赴任途中便聞潮州城有獨鬼“夜現形淫人婢”。郭子章知是歹徒所為，上任後便寫了壹篇令城隍神驅獨鬼的牒文，親到城隍廟去，並追問司祝者：“獨鬼是什麽形狀?”司祝說：“獨鬼知道知府大人要叫城隍縛他，他趕快走了。”獨鬼是何物，與司祝又什麽關系，不難推斷。
清代也有許多官吏破除鬼神迷信的事例，最堅決的莫過於雍正年間曾任普寧、潮陽知縣的藍鼎元。他是壹位正統的儒家學者，主張除崇祀儒家聖賢和祖宗、忠烈外，余者皆視為旁門左道。他在其所著《潮州風俗考》中，多方面抨擊潮州陋俗，其中列舉了“沈迷風水”、“信巫覡”等等迷信事象，說“鬼怪盛而淫邪興”。所以，凡遇迷信害民之事，他都堅決清除。潮陽城有個巫婆林妙貴，自稱後天教主，人稱仙姑，與其自稱仙公的奸夫胡阿秋狼狽為奸，在城北建廟，妖言惑眾，說能役鬼驅神，為人治病求子，能使寡婦再會亡夫。遠近各縣求之者甚眾，癡男怨女數百人尊之為師，日夜胡混，傷風敗俗，甚且還演戲多日，大張旗鼓。藍鼎元聞知，急令衙役拘捕，豈料這些衙役也怕“神仙”，豪紳宦眷也從中庇護，結果沒有抓到壹個人。藍鼎元便親自帶隊直搗妖穴淫館，從密室淫床中現抓到十余人，並繳獲能令人聞之便醉倒的悶香(迷魂香)等壹批罪證，訊知其害人騙人真相，將主犯胡阿秋、林妙貴縛赴遊街示眾，大枷處死，再將淫祠沒收，改建為棉陽書院，成為潮陽壹縣文教重地。
清代末年至民國初年，潮汕接受科學知識的漸多，壹部分先進知識界和官吏，已完全不相信有鬼神之說，並堅決鏟除迷信。清末潮陽縣東山高等小學堂總教習、民國初年首任潮陽中學校長蕭鳳翥就是其中壹人。蕭鳳翥初任東山書院高小學堂總教習時，其校址附近神廟甚多，迷信風極盛。當時東山校門前是“望仙橋”舊址，有兩棵大槐樹，被壹些善男信女當作樹神祭拜，人來人往，煙火繚繞。蕭風翥命校工阿尾搬掉香爐，將地方清掃幹凈，阿尾迷信，他對兩棵槐樹說：“我是奉校長之命而幹，求樹神寬宥”。晚間回家後，心神不寧，大嚷大叫，頭痛惡心，渾身不暢，由家人向蕭校長請假，蕭鳳翥給了些錢，囑延醫服藥，然後執手杖，對著槐樹喝道：“妳果其作怪，我明天把妳連根挖悼”。阿尾家人十分駭異，將情形告知阿尾。翌日阿尾竟神誌清醒，疑慮消除，照常上校工作。接著，蕭風翥將東山古跡“曲水流”附近廟內“水仙爺”、“註生娘”等神像搬出焚毀，引起縣城當時壹番轟動。當時棉城壹些地痞流氓，經常利用神像敲詐商家富戶，常在半夜三更，到城隍廟內搬出“皂隸”神像，置於富戶或商店門口，翌晨向其主人敲詐錢財。有壹次，地痞流氓搬兩身“皂隸”像，置於蕭風翥住宅“耐軒”門口，翌晨，蕭風翥發覺，即將神像焚毀，並聯系當時治安部門，懲辦肇事流氓，從此杜絕地方弊害。壹次，蕭風翥家中的小孩患麻疹，家屬求神禱佛，安設“娘爐”，蕭鳳翥對此進行勸阻，以科學道理告誡家屬應請醫診治，並將家中“娘爐”銷毀。影響所及，不少親朋戚友亦仿效其做法。蕭鳳翥認為人死後，按照家庭財力，辦理喪葬，毋須延僧理懺。他認為誦經念佛，事屬虛幻，乃浪費人力財力，毫無意義之舉，告誡家屬遵守教訓，傳說在他死後其家屬子孫，並無辦理延僧念佛之事。