忍者容器可分為五類:登船器、水容器、開啟器、火器和隱藏武器。
攀登者是忍者的攀登裝備，包括:綁梯、爬梯、折梯、鉤鉤、長飛、持棒、爬龍、尋梯、探鐵、苦爬、爬鉤、纏繞、爬梯。
水上船只包括:浮橋、沈橋、蒲筏、葛籠筏、水蜘蛛、水刮、鵜鶘、軍船等。
開瓶器是開櫃、拉門撬鎖時使用的作案工具，包括:外問、彎刀、伸鑰匙、插分鑰匙、鑷子、錐子、鐮刀、拔鎖、板撬、鋸、拔釘、聽鐵等。
火器由火器及其使用方法組成，包括:水火繩配方、水鐵炮配方、火盒、不熄宋明、打宋明法、籠火法、水下火法、風水火炬五法、火嘴法、熊火法、熟眠法、白楊火配方、用萬年火、伊宋景明、入子火、生滅宋明、藥燃法。
最常見的耐力裝備有手裏劍、忍者刀、護手甲和煙霧彈。這些都是忍者的基本裝備，平時出門作案妳可玩不起。
手裏劍有三種，除了飛鏢形的手裏劍，還有手裏劍和手裏劍。手裏劍像筷子，手裏劍像沒有柄的鐮刀，普通手裏劍根據形狀不同分為桿狀和扁平狀。
忍刀也叫“忍刀”。刀的長度大多短於60厘米，刀身寬而重。以直刀為主(不同於武士刀)，執行任務時經常作為攀爬的輔助工具。此外，它的鞘可以在水蜘蛛手術中用作呼吸工具和竊聽工具。
劍(刀)是日本武士榮譽的象征。武士通常佩戴兩把劍(刀)，長的叫太刀，短的叫斜叉，都是高碳鋼材質。薄刃可以用來纏繞手指，硬刃可以穿透裝甲護盾。毫不誇張地說，它削鐵如泥。據說二戰後美軍用步槍的槍管來招架匕首，但是步槍的槍管被匕首切斷了。
忍者用的劍比匕首短，只有24寸，質量遠不如武士刀，刀刃也鈍很多。所以忍者的刀不是用來砍的，主要是用來刺的。如果忍者和武士都用自己的刀戰鬥，忍者顯然處於劣勢。如果忍者想贏，他們必須采取其他措施。
忍者刀的刀身是鈍的，用手拿著不會流血。忍者的刀與其說是武器，不如說是多功能工具。如果短刀插在地上，刀的護環可以作為絆腳石；如果刀的護環掛得高，雙手就可以安全地握住刀刃往上爬。就連忍者的劍鞘也有很多用途。通常刀鞘比刀刃略長，可以用來藏毒品或隱藏武器。劍鞘的尖端也可以去掉，這樣劍鞘就變成了壹個中空的扁管，忍者藏在水下的時候就當通氣管用。在黑暗或暗室裏，刀鞘又成了忍者的“探測器”。
兩棍(博)是人類最原始的革命武器。它是革命性的，因為它的性能遠遠優於石頭或粗加工的石鏢和槍。石頭壹扔，他手裏的武器就沒了。棍棒很容易得到(隨便伸出壹根樹枝就行)，有利於近戰，可以投擲。鑒於此，忍者將棍棒視為第壹武器，並發展出壹系列使用棍棒的方法和技巧，稱為“棍棒術”。
忍者使用的棍子壹般直徑2英寸，長約5英尺:由硬木制成的棍子是實心棍子。實心棒的力量很大，壹旦被實心棒擊中，肌腱斷裂斷裂在所難免。如果打中關鍵部位，風險就更大了。空心棒重量更輕，看起來也不那麽危險，但空心棒更險惡。壹般的對手絕對想不到，忍者的手腕會輕輕壹抖，隱藏的武器，比如藏在空心桿裏的鐵彈、飛刀、短箭，就會扼住對方的咽喉或者正面正中。空心桿中還可以隱藏壹條5-6英尺長的鐵鏈，這樣從桿中溢出的鐵鏈就可以出其不意地綁住對手。
與棍子配套的武器是長約2英尺(約70厘米)的棍子(Jo)；它是壹種極好的防禦武器，可以用匕首或小刀對著對手砍、劈、刺或扔。
手裏劍，鐵蒺藜，類似於中國武林中的飛鏢。可以在10碼(約9米)範圍內百發百中。古代忍者的“手裏劍”壹般都沾了毒。壹般有八角形手裏劍、六角形手裏劍、十字形手裏劍、三角形手裏劍和萬字形手裏劍。這些手裏劍在被投擲後，會在空中繞其幾何中心旋轉，因此軌跡穩定，近距離也能保證壹定的精度。多邊形的手裏劍主要是用它鋒利的角殺死敵人，所以殺傷力有限。所以忍者會在每個角落塗上劇毒的毒藥(在《獸兵任偉·馮鐵》中，冒充和尚的幕府特工用手裏劍餵毒)，這是壹種非常危險的武器。忍者壹般在兩種場合使用手裏劍，壹種是暗殺，壹種是被多人圍攻，急於脫身。使用時，壹般可以壹次扔四五枚，增加命中率。這些手裏劍重量在40克到60克之間，壹般忍者不會帶幾十個。畢竟身輕如燕是他們的優勢。
古代女忍者很少使用“手裏劍”，取而代之的是用帶毒的發夾殺死敵人。
此外，還有壹些奇形怪狀的武器，大多脫胎於農具，如短月牙鐮、撓鉤、短刀等。壹般來說，這些鐮刀和鉤子被綁在壹根由馬毛或人毛制成的繩子上；和“手裏劍”差不多，只不過帶繩子的鉤子、鐮刀、刀送出後可以回收。
四個弓箭。忍者使用的弓分為大弓和小弓兩種。大弓用於遠距離射擊，小弓用於近距離射擊。除了射箭之外，還可以發射火箭、鳴笛箭、開花箭(可以爆裂的箭)騷擾敵人。現代忍者有手槍，弓箭笨重不方便。只有壹種弩吹至今仍在使用。弩的吹管裏藏著壹根鋼針。用力壹吹，鋼針就會發射，但發射距離只有兩三米。
五連環棍，類似於中國的流星錘，壹般長約1米，也是防禦性武器。它的重量和厚度各不相同，最小最輕的可以藏在袖子裏作為隱藏武器使用。
其實忍者常用的武器遠不止以上五種。壹根竹筷，壹根空心竹筒，壹根繩子，幾乎可以變成隨手可得的武器。