北魏延河年間，北石天道長毛口來臨朐傳教。參觀石門坊，看到簡陋的公廟，倡議村民集資，擴建，修繕場地，改為三筏，築脊造脊，雕梁畫棟。燕興五年(475年)，朝廷下令修建石門寺，後移至此處重修，規模有所提高。文成帝和三年(462)，在寺廟附近的懸崖上雕刻了十幾個壁龕，形體宏大，工藝精細，用於繪畫浮雕。北周建德三年(574年)，宇文雍皇帝下令拆廟毀佛，所有造像被砸碎。到了唐代，石門寺擴建修繕，成為青州以南的佛教中心。唐朝天寶年間，又增加了90多尊摩崖造像，其中不少是刻在土公廟的石壁上。晚唐會昌年間，石門寺被毀，大部分摩崖造像受損。宋元年(1054)，建菩薩廟，九尊。元大德八年(1304)，官方發布名單，規定石門坊的界線為“東至懸崖，南至峪口山寺廟，西至山後，北至清雅”四條，面積約10平方公裏。明代的寺廟幾經修繕，僧人發展到幾十人。天順三年(1461)，方丈高僧銀安去世，佛塔高7米多，直徑1.7米。精湛的工藝。嘉靖二十二年(1543)，壹位來自羅達的仙人遊覽石門坊，留下“坐於此巖谷，悠然忘世，釋子吹玉笛，疑是飛仙”的詩句，刻於東崖佛光石上，是石門坊現存最早的書法石刻。在清朝的260多年裏，寺廟和森林都保護得很好，雖然沒有加進去。民國八年(1919)，因為紙坊高中的建立，砍伐了十幾棵柏樹。民國二十四年(1935)新建文昌廟，修繕土公廟，派道士看管。
石門山從壹開始到1937都是原始森林覆蓋。茂林秀木，丘壑密布，崖上柏樹扭曲成石墻，如壹條巨龍倒掛，人入山不見日。山中植被完好，怪石嶙峋，裂縫滴水，山泉遍地，水流成溪，終年不化。1937年，日軍侵華，石門坊被劫。1940年冬，日軍在大灘馬莊修建據點，強迫民夫砍伐石門坊樹木。連續三年，樹木被徹底砍伐，石門山成了光禿禿的山。泉水斷流，山澗幹涸，寺廟全毀，到處都是小的。1950後，大灘馬莊村成立石門坊林業隊，植樹造林，封山育林，加強文物保護，石門坊景區進入施工期。
石門坊以美、奇、美、幽、險著稱。馬頭如神馬，太平如飛虎。兩地對峙，猶如牌坊拔地撐天，故名石門坊。遊客登上太平谷山頂，兩邊山谷幽深，顫抖如虎背。古頂上有全石結構的古跡和小廟，結構奇特。石門坊的北面，有幾疊谷峰，山路蜿蜒，千松萬壑，宛如壹座深邃無邊的洞府花園。15各種方式的洞，或險，或美，或幽。白石塔疊於天之上，威勢如巨佛立於山溝之中。垂直的墻像壹個切割的懸崖，有壹個石頭房子，壹個老和尚曾經坐在裏面。山頂有壹個噴湧而出的噴泉，旱季時不斷滴水，汛期時噴發成瀑布。石門坊風景區真是世界奇觀。遊客留下贊美的詩句，“香山紅葉好，石門色更濃”。