1059年，第三任特使張因購買當地土豪的財物，被包拯彈劾罷官。後來，宋祁接任第三任特使。包拯再次彈劾宋祁，宋祁被罷免後，包拯暫任三秘，學士。
對此，歐陽修表示:包拯彈劾兩個三秘的處罰已經很重了，但包拯僅僅因為貪欲就去擔任三秘，這就太過分了。包拯聽說後，沒有擔任三秘，而是留在了家裏。當宋仁宗知道這件事時，包拯是不允許這樣做的。
1061年3月，包拯被提拔為總書記，隨後宋仁宗又提拔包拯為副使節。調任禮部侍郎，但包拯拒絕接受。
1062年5月，在樞密院工作時，包拯突然生病。七月三日，包拯病重去世，享年六十四歲。
擴展數據:
北宋名臣包拯在民間非常有名，因為他敢於為民申冤，而且不畏強權，從不極力依附權貴。因此，人們稱他為“真命天子”。
有什麽事，就去找他，只要是對的，包拯都會盡力幫助他。他死後，人們更加尊崇他的地位，把他當作神來崇拜。都說他是魁星轉世，特別為民。
值得壹提的是，民間有很多關於他的傳說。他的形象很有意思。據說他整天就是個黑臉形象。在現代歷史劇裏，包拯通常被演成壹張黑臉，額頭上有壹個月亮。
包拯的工具為他樹敵不少，百姓都愛他。但這樣壹來，他得罪的都是有權有勢的人。
當他活著的時候，沒有人敢做任何事情，因為它是如此受歡迎，沒有人會去中風的厄運。但是他死後，就不壹樣了。古人有很多報復的方式。即使他死了，他也會把它挖出來鞭打屍體。
包拯知道這壹點，他做了充分的準備。歷史上包拯出殯的那壹天，二十壹口棺材同時從大門擡出，人們不解為什麽要這樣做。原因很簡單，就是為了避免在敵人死後制造麻煩。
值得壹提的是，徐金國被殺後，皇帝特意派人修復了包拯所有的陵墓，因為不知道是哪壹座，所以只能全部修復。
包拯下葬後，發生了壹件有趣的事情，就是盜墓賊看到這種情況，直接立下了壹個規矩，這也是盜墓行業的大忌，就是不準偷墓地和包拯的墓。
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