中醫的病因分為外感和內傷兩大類。外因包括六淫、疫疾；內傷包括七情、飲食、作息等。中醫所說的“邪氣”包括各種能導致人體功能失調、內外環境失衡的致病因素。
如六淫，即風、寒、濕、燥、火，又稱六氣，包括引起感染性疾病的邪氣，是引起外感疾病的外邪之氣。正氣受損，邪氣乘虛而入。
中醫認為，疾病的過程就是正氣與邪氣鬥爭的過程。隨著正氣的增長，疾病會向好的方向發展；隨著邪氣的增長，疾病會向不好的方向發展，所以治療的實際意義，無論是祛邪扶正，還是扶正祛邪同時進行，都是為了促進正氣戰勝邪氣。