劇情簡介:保潔公司的主管藤井被從樓上落下的重物砸死。警察在屍體旁邊發現了壹個沒有指紋的器官。柯南認為這不是壹起簡單的事故，而是壹起謀殺。當警察去保潔公司社長中山的辦公室調查時，這裏的監視器引起了柯南的興趣。簡單操作了監視器，簡單查看了攝影內容後，兇手浮出了水面。
61集鬼船殺人(上)
劇情簡介:七年前，滿載著相當於十億日元黃金的神之神，突然出現在福島附近的海域。第三天，以鬼船為噱頭的村長邀請小五郎演講，他的真實目的是想讓小五郎找出黃金的下落。演講過程中，小五郎差點死在講臺上。兇手很可能是島上的警衛濱田和旅行社職員上原。他們似乎也是老朋友了。當晚，小五郎追蹤到襲擊他的武士，卻被打昏，落入兇手的圈套，成為殺害濱田的兇手。
62集鬼船殺人(下)
劇情簡介:就在警察試圖強行帶走小五郎的時候，柯南在機械室和濱田的屍體上發現了強有力的證據，幫助他洗清嫌疑。目前來看，上原是最有可能的兇手。當所有人都試圖秘密逮捕上原的時候，木下挺身而出，說要勸他投降。5分鐘後，屋內響起槍聲，上原在樹下開槍逃走。柯南回去調查了宇神，和貝爾壹起進入了海軍洞，卻在這裏發現了上原的屍體。
第65集綁架螃蟹和鯨魚
劇情簡介:在壹家酒店吃飯時，壹個神情不安的男人引起了柯南的註意。柯南等人偷偷跟著他，進壹步打聽，這個人叫遠藤，他的兒子被綁架了。為了保護兒子的安全，小五郎決定幫助他。第二天，犯人打電話要錢。遠藤聽兒子說有螃蟹和鯨魚，這是找到犯人據點的唯壹線索。小蘭、柯南和小五郎走街串巷，尋找有螃蟹和鯨魚的地方。柯南想起了缺失的線索，成功找到了有螃蟹和鯨魚的地方，解救了人質。
76集柯南VS海東黑場
劇情簡介:木叉警官要求所有來賓互相示意，防止基德混入。這時，船突然暗了下來，基德出現在光束中，鈴木太太毫不猶豫地向他開槍。混亂中，鈴木夫人解釋說這是她請來的真正的魔術師，小蘭在卡片魔術中畫出了基德的信息。這時，散落的珍珠在地上爆炸了，客人們焦躁不安，給鈴木夫人戴上了“暗星”。
80集流浪畫家謀殺案
劇情簡介:袁夫人在打棒球的時候，不小心打傷了壹個流浪的畫家，送到醫院檢查後才知道他失憶了，然後畫家就悄悄離開了。幾天後，畫家的屍體被發現。為了調查真相，派出了壹個少年偵探小組。他們根據畫家的草圖找到了壹個叫早瀨的家。主人熱情地招待孩子們。柯南註意到這位女士丈夫的肖像與死者非常相似。經過進壹步調查，他將銀杏、窗戶、燒焦的痕跡、受害者與眼鏡和墻上的畫聯系起來。沒錯！她是兇手。
81第壹集綁架流行歌手(第壹部)
劇情簡介:壹次偶然的機會，少年偵探隊與最受歡迎的組合TWO-MIX的主唱高山南共進晚餐。高山獨自跑出演唱會場地去找搭檔永野椎菜。後來在餐廳外，歹徒在柯南面前的車裏綁架了高山。他們讓少年偵探隊用TWO-MIX的最新歌曲練習，帶他們去交換人質。電話中，歹徒要求少年偵探隊擺脫警察，向美國屈服，於是柯南和布美互換了身份。
82集綁架流行歌手(第二部)
劇情簡介:柯南離開的時候，雖然告訴了袁夫人他們把追蹤眼鏡交給了警察，但是想立功的偵探隊還是私自行動，用眼鏡找到了柯南的位置。當他準備報警時，被歹徒發現了。二混壹見就能解救，柯南卻因為袁泰等人的綁架再次落入敵手。在他揭穿歹徒練腰帶的目的後，歹徒惱羞成怒，點燃了屋內的汽油。柯南等人能成功逃脫嗎？
104集盜賊集團別墅事件(第壹部)
劇情簡介:有壹天，小五郎收到壹封請求信。壹個叫曹中村的人說，自從搬進他繼承的別墅後，他遇到了許多奇怪的事情。到達後，柯南發現別墅裏真的充滿了謎團。大門的扶手上少了雕像，別墅裏到處都是動物時鐘，所有的數字時鐘都有同樣的劃痕。屋頂的閣樓裏好像有人，十年前高風盜竊集團相關的新聞資料，高爾夫球包上的惡魔二字。
105集盜賊集團別墅事件(第二部)
劇情簡介:柯南註意到恐怖怪獸的頭上有“R”、“L”、“N”三個字母，將數字鐘上被劃痕隔開的11: 0組合起來，解開了屋內的謎題。在他的提醒下，小五郎漸漸明白了這些暗號的含義。晚上，大家按照主人留下的暗號再次返回。
112第七集迪丹小學的詭異事件
劇情簡介:學校最近發生了很多奇怪的事情，院長不請假就消失了好幾天。柯南問老師和校長這件事的時候，大家都保持沈默。為了調查真相，少年偵探隊在晚上走訪了迪丹小學，有學生名字的娃娃，會動的人體模型，窗戶後面的影子，樓梯上的煙，扶手上的紅漆，幾十個影子突然出現在他的班上，雖然這壹切都有賴於此。
129集來自黑組織的女子大學教授被害案。
劇情簡介:壹個叫海原愛的女生被轉到柯南的班上，當天少年偵探隊就接到了同校的委托，幫忙尋找他的哥哥。我們去葉君家調查，發現了壹幅夏目·索世基的畫像。葉君說壹個穿黑衣服的女人曾經欣賞過這幅畫。柯南壹聽，立刻將其與涉黑組織聯系起來，並迅速帶領偵探團隊尋找線索。期間，他在壹家便利店認識了壹個用戶。
346集尋找屁股上的印記(第壹部)
劇情簡介:小五郎帶著柯南和小蘭去杜東國家科學技術博物館觀看無敵面具角鬥士狼人的競技表演。後來，柯南在會上遇到的大神景清知道了狼人的真實身份。然而，就在比賽開始前，狼人的對手永瀨安田被暗殺後的屍體突然被發現。而且在兇案現場發現了隱形視頻，裏面記錄了兇手！通過判斷蒙面殺手的體型，確定他是四個人中的壹個。
347集尋找屁股上的印記(第二部)
劇情簡介:然而，在休息室裏發現了掩蓋真相的角鬥士狼人的對手——長瀨豹。從案發時拍攝的錄像帶來看，牧牧警察廳確定了四名角鬥士，即狼人、牛快彥、佐助浩誌和狼，是審問的嫌疑人。另壹方面，柯南看到視頻中拍到的犯人後腦勺，註意到不自然的地方，推斷出兇手的真實身份。而正是因為對面具的不適應，才暴露了兇手的真實身份。在視頻中的證據面前，兇手終於承認了自己的罪行。
350集被遺忘的手機(第壹部)
劇情簡介:朱迪打算辭去學校英語老師的工作，返回美國。小蘭和園方為朱蒂舉行了歡送會。當他們去找他們的中學同學齊川時，發現她正被她工作的便利店訓斥。為了洗清朋友小偷的嫌疑，小蘭等人開始尋找壹個不留痕跡的小偷。但是從監控錄像和店長的證詞都沒有看到小偷的蹤跡，店長還準備把奇川送去派出所！
351集被遺忘的手機(第二部)
劇情簡介:當小蘭和其他人陷入困境時，心怡打來電話。小蘭在電話裏說明了情況，並指出有三個陌生客人借用了便利店的廁所。但在貨物失蹤的當天，按規定只有七川在值班。小蘭在新壹的指引下，根據新壹的提示，辨認出犯人，找出犯人。店長以退還贓物為由，讓犯人陷入困境。七川也洗清了嫌疑。
509集紅白黃和偵探組
劇情簡介:30年前，莊唐核桃被壹個少年從車禍中救了出來。現在，她想把意外獲得的1億獎金轉給她的恩人。線索是少年身上的巨大傷疤和夏日海灘的記憶。期間有兩名男子前來認領。為了鑒定誰是正品，柯南他們來到了莊唐的家。沒想到遇到壹個正在尋找即將超過追訴期限的殺人案件的警察，因為兇手。那天晚上，小五郎洗澡的時候，發現管家太傅包谷的背上有壹道疤。核桃記憶中的少年是誰？
510集柯南vs雙碼之謎
劇情簡介:柯南、小蘭和小五郎壹起逛街。沒想到，書店附近傳來壹聲尖叫。我看到壹個人躺在血泊中不省人事。接到電話的警察趕到現場，立即將其封鎖。在此期間，柯南和阿沙拉從壹個小偷那裏了解到了壹些關於歹徒的信息。後來，他們調查了樓上的牙科診所。根據收集到的信息，他們鎖定了目標。就在歹徒試圖再次傷人時，警察
511集推理對抗！新沂VS沖矢昴
劇情簡介:平治和柯南通電話的時候，聊到了壹個初中沒見過的仇人。當時平治和同學來山裏滑雪，不想遇上壹起命案。死者是著名演員吉倫獎士兵。這個案件與四年前這裏發生的謀殺案非常相似。遇難者都死在纜車上，身邊的背包裏全是雪。在調查的過程中，服部哲總是從別人口中聽到壹個同樣參與破案的初中生，而這個人就是工藤新壹，服部哲不禁與這個“看不見”的對手較勁。