乾隆四十八年(1783)，柳永升任直隸總督，協辦大學士，同時掌管國子監事務。
乾隆五十壹年(1786)，任玉亭副社長。但在隨後的幾年裏，柳永不斷犯錯，官聲變差，屢遭皇帝責罵。
乾隆五十二年(1787)初，柳永因泄露與皇帝關於與曹的談話內容而被申斥，並被解除協辦人職務。八月，乾隆委托柳永主持文廟祭祀，因未按規定鞠躬，被太常寺清德寶違規參加。
乾隆五十三年(1788)夏，柳永兼管國子監期間，發生了壹起鄉試考生餵堂官受賄案，被禦史朱彈劾，柳永受到處分。
乾隆五十四年(1789)四月，上書房的王公老爺們久久不能到達書房。作為主廚的柳永拒不改正，被貶為吏部侍郎。
乾隆五十八年(1793)，柳永擔任當年考試的考官，但他對閱卷安排不當，導致大量試卷違規、不合格。
乾隆五十九年(1794)遷閣，學士，官至尚書。
嘉慶二年(1797)三月，柳永被授予體仁閣學士，卻被太上皇(乾隆)指責總是不肯真心做事，工作懶散，說他提拔柳永是因為沒有其他人選。五月，柳永隨尚書慶貴赴山東辦案，視察黃河決口。柳永上書請求在決口處築壩，分流下遊，朝廷采納了意見。
柳永做官的晚年總是犯錯，惹得乾隆壹頓臭罵。有壹段時間北京下雨，上書房教皇書房的師傅們連續幾天不開課，但上書房的師傅是柳永。乾隆得知後很生氣，說柳永違約，降了職；後來，他擔任了考試的考官。由於他的安排倉促，沒有認真註意試卷，導致了許多不合格的試卷。也是典型的“考官默認”，自然更加不得人心。
壹系列的事件讓柳永失去了被授予大學學位的機會，直到後來才在體仁閣被授予大學學位。柳永壹生沒有進過軍部，也沒有接觸過皇權的政治權力中心。後人稱柳永為丞相，大概是不恰當的。這裏要說明的是，清朝沒有宰相這個職位。之所以有“宰相劉”之說，是因為柳永的最高職位相當於明朝以前的宰相。
柳永做官前後差別很大。他犯的錯誤沒大沒小，沒有被皇帝砍頭，卻經常被皇帝罵。柳永之所以從剛正不阿走向糊塗，是因為那些庸庸碌碌、糊裏糊塗、不能居功的人更受乾隆喜歡。柳永恰恰是看透了這壹點，所以他寧願被迷惑，最起碼他可以保護自己。當然，這種思維是我們今天所不能接受的，這樣的“好人”官員也不可能為人民謀福祉。但在柳永的時代，面對乾隆這樣的君主，柳永有時也不得不這樣做。