在打倒嚴嵩父子的過程中，徐階的心機表現得淋漓盡致。徐階首先給嘉靖皇帝介紹了壹個道士。嘉靖帝問秀才，誰是奸臣，誰是賢臣。道士說嚴嵩、徐階，借以離間嘉靖皇帝與嚴嵩父子。此後，趁熱打鐵，徐階收集了嚴世蕃違法違紀、買官賣官的確切證據，然後寫成文字呈上。嘉靖皇帝看到後，大怒。當下，下令將嚴世蕃下獄，發配邊疆，驅逐大軍；又將嚴嵩革職。
嚴嵩罷官後，嘉靖皇帝覺得沒有老友不舒服，就想重新起用嚴嵩。為了讓嘉靖皇帝打消這個念頭，徐階趁熱打鐵，開始鏟除嚴嵩的羽翼。他暗中將嚴嵩的黨羽革職或直接處決，使嚴嵩的權力大減。
後來嚴世蕃在充軍路上逃亡，想暗殺徐階，這正是徐階想要的。徐階立即拿了壹本《嚴世蕃》獻給嘉靖皇帝。嘉靖皇帝大怒，立即派禦林軍捉拿嚴世蕃，很快嚴世蕃被帶回朝廷。
此後，徐階親自給嚴世蕃定罪。經過慎重考慮，徐階給嚴世蕃定下了三項罪名:
首先是嚴世蕃勾結日本人，在沿海起義，企圖逃往日本。
二是嚴世蕃勾結江洋大盜，建立私人武裝，圖謀不軌。
三是嚴世蕃帶著帝王的氣息霸占地塊，建造私宅。
要知道，嘉靖皇帝是痛恨與敵人同流合汙的。只有這個人能判嚴世蕃死刑。此外，在那個時候，有人目睹了嚴世蕃與敵人的勾結，嚴世蕃無法逃脫。此後，嚴世蕃被嘉靖皇帝直接處死。從此，嚴嵩再也沒能起來。可見，徐階的算計。