《馬大帥3》的故事延續了前兩部。入城第三年，馬大帥經歷了各種挫折和磨難，他終於想回到自己的根本。
馬大帥和他的妻子於芬去了城裏工作，後來在他女兒開的美容院做助理經理。這麽多年來，他在這個城市認識了許多重要的人物。當然，他也遭受了許多挫折。學校沒了，校長也當不了校長了。他還在沒有告訴於芬的情況下擔任了壹名危險的蜘蛛俠，但他因為工作太努力而丟掉了工作。
另壹個英雄範德彪在壹個小診所裏做醫護人員。這種不公平的占領肯定不會持續太久。範德彪和馬大帥面臨著同樣的困難。在城市裏闖出壹番名堂真的不容易。最後，他們回到了馬家堡子，開始了新的生活。