萬歷不上朝的主要原因是皇權與文官制度發生了激烈的沖突，皇權受到壓制，萬歷以消極的方式與之對抗。不過，有兩件事還是值得肯定的。萬歷皇帝沒有因為大臣反對甚至責罵皇帝的貴妃而殺壹個人，已經相當寬大了。其次，不打官司不代表不上班。萬歷時期，國家大事小事都由萬歷處理，比如萬歷三大特點，尤其是明日之間的非陳之戰，總是在萬歷的指導下進行。小的如利瑪竇在北京傳教，建教堂，月供甚至墓地，都是在萬歷的追問下順利進行的。西方傳教士對萬歷充滿了敬意和感情，對東西方文明的交流起到了相當大的作用。
其次，派太監設礦監、稅監收錢肯定是不好的壹面，但要具體分析。礦監的出現，是基於萬歷的政令，從此可以開礦，原意是不與民爭利，所以派礦監。太監念經歪了，鬧得很大。這壹時期的醫療事故持續了大約四年。四年後，萬歷禁止宦官出宮斂財，但礦禁取消。無疑，它將從現在起促進資本主義經濟的發展。在所有國家的歷史上，封建國家都剝奪了工商業的超額利潤。明朝所做的就是找借口，提高稅率。漢武帝時期，商人們被勒令讓出壹半財產來協助政府，導致“大量商人們家破人亡”。但是明朝的工商業者已經成為相當強大的社會力量，他們是受不了這種加稅的。礦長遭到大規模反對，稅收引發的民間動亂不斷發生。(見儒家文明)從新生事物的成長來看，有適當的沖突和矛盾有利於其成長。
統治階級內部的矛盾更多是因為他不顧國家大事，大臣的奏折和政令都是由內侍傳達的。授予王儲的事件長期拖延，導致官僚集團各派之間的沖突和黨派鬥爭加劇。林東黨和邪惡黨之間的鬥爭持續了很長時間，明朝處於崩潰的邊緣。萬歷四十八年(1620)，朱翊鈞死於58歲，困於內外，風雨飄搖。葬於定陵，謚號範天河道遁劍光條武安任獻帝，廟號為。