建於明朝萬歷年間，原址位於賓西門(東門)外，青陽港與澮河(今昆太路以南)交匯處，龍王與總管分水處。
同時修建了玉珠塔(俗稱白塔)，故又稱白塔龍王廟。2002年，經市政府批準，由昆山市道教協會負責搬遷重建，2004年建成開放。如今，白塔龍王廟位於周氏鎮春暉路，由昆山市道教協會管理。