庫峪河，是長安與藍田兩縣的界河，發源於長安區東南部秦嶺主脊北坡，向北流經庫峪口山，在長安杜明鄉匯入產河，長37.7公裏，流域面積119.75平方公裏(壹說庫峪河流域面積197平方公裏 其中河谷長19.3公裏，左岸有11溝渠，如馬鞍溝、紅廟溝、西母寺溝、切溝等，右岸有10溝渠。 谷外左岸有拉炮峪、關峪、石沙溝、火石溝、楓香溝、庫峪西溝、清水河，右岸有車家河。
湯峪河，又名石門峪水，發源於湯峪鄉南月亮石東北1.5km處，向西北流至陡井溝口，先後匯集水層溝水、鐵關溝水、劉家溝水，至東溝口，向北流，再匯集半溝水、黃毛溝水、南溝水、野豬窩水、小蒜溝水。
岱崮河又名焦岱河，發源於魏紫北麓的老溝，向東北流，流入西溝、東溝後流向花山寺，再流入白神洞，再向東北流入小寨鄉，再流入焦岱鎮以北的小寨溝水、寺溝水、和尚溝水、牛心峪水、老虎溝水。
靖宇溝河，誤稱鯨谷水，古稱長水。發源於藍田京山腳下的毛家十字，向西北方向流動，先後到達灰峪溝水、聚賢坊水、韓家溝水、李家溝水，到達孟村鄉朱家溝村，南入長安界，流程長約16公裏。然後流向西北11 km至灞橋區高橋橋西3 km匯入浐河。
在長安區，除了唐代之外，還有小河(發源於藍田)、苦於河、木魚溝、玉元溝、蠶溝、靖宇溝等支流。